Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pcf11G3X9Z4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pcf11G3X9Z4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Pcf11G3X9Z4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pcf11G3X9Z4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pcf11G3X9Z4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pcf11G3X9Z4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pcf11G3X9Z4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pcf11G3X9Z4 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pcf11G3X9Z4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pcf11G3X9Z4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Pcf11G3X9Z4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pcf11G3X9Z4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pcf11G3X9Z4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pcf11G3X9Z4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pcf11G3X9Z4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pcf11G3X9Z4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pcf11G3X9Z4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pcf11G3X9Z4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Pcf11G3X9Z4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pcf11G3X9Z4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pcf11G3X9Z4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pcf11G3X9Z4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pcf11G3X9Z4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pcf11G3X9Z4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pcf11G3X9Z4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pcf11G3X9Z4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Pcf11G3X9Z4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pcf11G3X9Z4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pcf11G3X9Z4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pcf11G3X9Z4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pcf11G3X9Z4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pcf11G3X9Z4 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pcf11G3X9Z4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pcf11G3X9Z4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pcf11G3X9Z4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Pcf11G3X9Z4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pcf11G3X9Z4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pcf11G3X9Z4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pcf11G3X9Z4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Pcf11G3X9Z4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pcf11G3X9Z4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pcf11G3X9Z4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pcf11G3X9Z4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pcf11G3X9Z4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pcf11G3X9Z4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Pcf11G3X9Z4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pcf11G3X9Z4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pcf11G3X9Z4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pcf11G3X9Z4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pcf11G3X9Z4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pcf11G3X9Z4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pcf11G3X9Z4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pcf11G3X9Z4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pcf11G3X9Z4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pcf11G3X9Z4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pcf11G3X9Z4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pcf11G3X9Z4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pcf11G3X9Z4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pcf11G3X9Z4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pcf11G3X9Z4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pcf11G3X9Z4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pcf11G3X9Z4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pcf11G3X9Z4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pcf11G3X9Z4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pcf11G3X9Z4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pcf11G3X9Z4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pcf11G3X9Z4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pcf11G3X9Z4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pcf11G3X9Z4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pcf11G3X9Z4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pcf11G3X9Z4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pcf11G3X9Z4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pcf11G3X9Z4 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Pcf11G3X9Z4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pcf11G3X9Z4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pcf11G3X9Z4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pcf11G3X9Z4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pcf11G3X9Z4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pcf11G3X9Z4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Pcf11G3X9Z4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pcf11G3X9Z4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pcf11G3X9Z4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Pcf11G3X9Z4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pcf11G3X9Z4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pcf11G3X9Z4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pcf11G3X9Z4 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Pcf11G3X9Z4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Pcf11G3X9Z4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pcf11G3X9Z4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms