Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hmgxb3G3X9M3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hmgxb3G3X9M3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hmgxb3G3X9M3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms