Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Srp72F8VQC1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Srp72F8VQC1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms