Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Arid4aF8VPQ2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arid4aF8VPQ2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms