Protein–RNA interactions for Protein: F6Z6Z2

3110082J24Rik, RIKEN cDNA 3110082J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110082J24RikF6Z6Z2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
3110082J24RikF6Z6Z2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
3110082J24RikF6Z6Z2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms