Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm10378F6XQQ1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm10378F6XQQ1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm10378F6XQQ1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm10378F6XQQ1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm10378F6XQQ1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm10378F6XQQ1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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Gm10378F6XQQ1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm10378F6XQQ1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm10378F6XQQ1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm10378F6XQQ1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm10378F6XQQ1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm10378F6XQQ1 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm10378F6XQQ1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm10378F6XQQ1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm10378F6XQQ1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm10378F6XQQ1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm10378F6XQQ1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm10378F6XQQ1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm10378F6XQQ1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm10378F6XQQ1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm10378F6XQQ1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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Gm10378F6XQQ1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm10378F6XQQ1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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Gm10378F6XQQ1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm10378F6XQQ1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm10378F6XQQ1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm10378F6XQQ1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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Gm10378F6XQQ1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm10378F6XQQ1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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Gm10378F6XQQ1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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Gm10378F6XQQ1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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Gm10378F6XQQ1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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Gm10378F6XQQ1 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm10378F6XQQ1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
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Gm10378F6XQQ1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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Gm10378F6XQQ1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm10378F6XQQ1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm10378F6XQQ1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm10378F6XQQ1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm10378F6XQQ1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm10378F6XQQ1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm10378F6XQQ1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm10378F6XQQ1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm10378F6XQQ1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm10378F6XQQ1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm10378F6XQQ1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm10378F6XQQ1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm10378F6XQQ1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm10378F6XQQ1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm10378F6XQQ1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm10378F6XQQ1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm10378F6XQQ1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm10378F6XQQ1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm10378F6XQQ1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gm10378F6XQQ1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
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