Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Crocc2F6XLV1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Crocc2F6XLV1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Crocc2F6XLV1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Crocc2F6XLV1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Crocc2F6XLV1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Crocc2F6XLV1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Crocc2F6XLV1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Crocc2F6XLV1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Crocc2F6XLV1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Crocc2F6XLV1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Crocc2F6XLV1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Crocc2F6XLV1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Crocc2F6XLV1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Crocc2F6XLV1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Crocc2F6XLV1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Crocc2F6XLV1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Crocc2F6XLV1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Crocc2F6XLV1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Crocc2F6XLV1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Crocc2F6XLV1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Crocc2F6XLV1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Crocc2F6XLV1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Crocc2F6XLV1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Crocc2F6XLV1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Crocc2F6XLV1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Crocc2F6XLV1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Crocc2F6XLV1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Crocc2F6XLV1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Crocc2F6XLV1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Crocc2F6XLV1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Crocc2F6XLV1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Crocc2F6XLV1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Crocc2F6XLV1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Crocc2F6XLV1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Crocc2F6XLV1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Crocc2F6XLV1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Crocc2F6XLV1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Crocc2F6XLV1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Crocc2F6XLV1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Crocc2F6XLV1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Crocc2F6XLV1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Crocc2F6XLV1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Crocc2F6XLV1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Crocc2F6XLV1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Crocc2F6XLV1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Crocc2F6XLV1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Crocc2F6XLV1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Crocc2F6XLV1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Crocc2F6XLV1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Crocc2F6XLV1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Crocc2F6XLV1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Crocc2F6XLV1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Crocc2F6XLV1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
Crocc2F6XLV1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
Crocc2F6XLV1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Crocc2F6XLV1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Crocc2F6XLV1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Crocc2F6XLV1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Crocc2F6XLV1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 163.8 ms