Protein–RNA interactions for Protein: F6QRE9

Erich3, Glutamate-rich 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erich3F6QRE9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Erich3F6QRE9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Erich3F6QRE9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Erich3F6QRE9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Erich3F6QRE9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Erich3F6QRE9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Erich3F6QRE9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Erich3F6QRE9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Erich3F6QRE9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Erich3F6QRE9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Erich3F6QRE9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Erich3F6QRE9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Erich3F6QRE9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Erich3F6QRE9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Erich3F6QRE9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Erich3F6QRE9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Erich3F6QRE9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Erich3F6QRE9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Erich3F6QRE9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Erich3F6QRE9 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Erich3F6QRE9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Erich3F6QRE9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Erich3F6QRE9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Erich3F6QRE9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Erich3F6QRE9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Erich3F6QRE9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Erich3F6QRE9 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Erich3F6QRE9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Erich3F6QRE9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Erich3F6QRE9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Erich3F6QRE9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Erich3F6QRE9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Erich3F6QRE9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Erich3F6QRE9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Erich3F6QRE9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Erich3F6QRE9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Erich3F6QRE9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Erich3F6QRE9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Erich3F6QRE9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Erich3F6QRE9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Erich3F6QRE9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Erich3F6QRE9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Erich3F6QRE9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Erich3F6QRE9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Erich3F6QRE9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Erich3F6QRE9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms