Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TrdnE9Q9K5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TrdnE9Q9K5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms