Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Col22a1E9Q7P1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Col22a1E9Q7P1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col22a1E9Q7P1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col22a1E9Q7P1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col22a1E9Q7P1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col22a1E9Q7P1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col22a1E9Q7P1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Col22a1E9Q7P1 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Col22a1E9Q7P1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col22a1E9Q7P1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col22a1E9Q7P1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col22a1E9Q7P1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col22a1E9Q7P1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col22a1E9Q7P1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col22a1E9Q7P1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col22a1E9Q7P1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col22a1E9Q7P1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col22a1E9Q7P1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col22a1E9Q7P1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col22a1E9Q7P1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col22a1E9Q7P1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col22a1E9Q7P1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col22a1E9Q7P1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col22a1E9Q7P1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col22a1E9Q7P1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col22a1E9Q7P1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col22a1E9Q7P1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col22a1E9Q7P1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col22a1E9Q7P1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col22a1E9Q7P1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col22a1E9Q7P1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Col22a1E9Q7P1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col22a1E9Q7P1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col22a1E9Q7P1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col22a1E9Q7P1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col22a1E9Q7P1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Col22a1E9Q7P1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col22a1E9Q7P1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col22a1E9Q7P1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Col22a1E9Q7P1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col22a1E9Q7P1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col22a1E9Q7P1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col22a1E9Q7P1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col22a1E9Q7P1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col22a1E9Q7P1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col22a1E9Q7P1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col22a1E9Q7P1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col22a1E9Q7P1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col22a1E9Q7P1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col22a1E9Q7P1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col22a1E9Q7P1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col22a1E9Q7P1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col22a1E9Q7P1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col22a1E9Q7P1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col22a1E9Q7P1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col22a1E9Q7P1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms