Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Urb2E9Q7L1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Urb2E9Q7L1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Urb2E9Q7L1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Urb2E9Q7L1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Urb2E9Q7L1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Urb2E9Q7L1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Urb2E9Q7L1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Urb2E9Q7L1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Urb2E9Q7L1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Urb2E9Q7L1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Urb2E9Q7L1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Urb2E9Q7L1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Urb2E9Q7L1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Urb2E9Q7L1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Urb2E9Q7L1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Urb2E9Q7L1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Urb2E9Q7L1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Urb2E9Q7L1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Urb2E9Q7L1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Urb2E9Q7L1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Urb2E9Q7L1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Urb2E9Q7L1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Urb2E9Q7L1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Urb2E9Q7L1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Urb2E9Q7L1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Urb2E9Q7L1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Urb2E9Q7L1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Urb2E9Q7L1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Urb2E9Q7L1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Urb2E9Q7L1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Urb2E9Q7L1 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Urb2E9Q7L1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Urb2E9Q7L1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Urb2E9Q7L1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Urb2E9Q7L1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Urb2E9Q7L1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Urb2E9Q7L1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Urb2E9Q7L1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Urb2E9Q7L1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Urb2E9Q7L1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Urb2E9Q7L1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Urb2E9Q7L1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Urb2E9Q7L1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Urb2E9Q7L1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Urb2E9Q7L1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
Urb2E9Q7L1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Urb2E9Q7L1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Urb2E9Q7L1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
Urb2E9Q7L1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Urb2E9Q7L1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
Urb2E9Q7L1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Urb2E9Q7L1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Urb2E9Q7L1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Urb2E9Q7L1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Urb2E9Q7L1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Urb2E9Q7L1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Urb2E9Q7L1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Urb2E9Q7L1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Urb2E9Q7L1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
Urb2E9Q7L1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Urb2E9Q7L1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
Urb2E9Q7L1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Urb2E9Q7L1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Urb2E9Q7L1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Urb2E9Q7L1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Urb2E9Q7L1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Urb2E9Q7L1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Urb2E9Q7L1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Urb2E9Q7L1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Urb2E9Q7L1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Urb2E9Q7L1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Urb2E9Q7L1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Urb2E9Q7L1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Urb2E9Q7L1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Urb2E9Q7L1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Urb2E9Q7L1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Urb2E9Q7L1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Urb2E9Q7L1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Urb2E9Q7L1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Urb2E9Q7L1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Urb2E9Q7L1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Urb2E9Q7L1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Urb2E9Q7L1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Urb2E9Q7L1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Urb2E9Q7L1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Urb2E9Q7L1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Urb2E9Q7L1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Urb2E9Q7L1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Urb2E9Q7L1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Urb2E9Q7L1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Urb2E9Q7L1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Urb2E9Q7L1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Urb2E9Q7L1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
Urb2E9Q7L1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Urb2E9Q7L1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Urb2E9Q7L1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Urb2E9Q7L1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Urb2E9Q7L1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Urb2E9Q7L1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms