Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ccdc85cE9Q6B2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc85cE9Q6B2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms