Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4S1

Pde8b, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, mousemouse

Predictions only

Length 865 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde8bE9Q4S1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pde8bE9Q4S1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pde8bE9Q4S1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
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