Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3P4

Cenpf, Centromere protein F, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpfE9Q3P4 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CenpfE9Q3P4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CenpfE9Q3P4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CenpfE9Q3P4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CenpfE9Q3P4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CenpfE9Q3P4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CenpfE9Q3P4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CenpfE9Q3P4 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CenpfE9Q3P4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CenpfE9Q3P4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CenpfE9Q3P4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CenpfE9Q3P4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CenpfE9Q3P4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CenpfE9Q3P4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CenpfE9Q3P4 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CenpfE9Q3P4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CenpfE9Q3P4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CenpfE9Q3P4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CenpfE9Q3P4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CenpfE9Q3P4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CenpfE9Q3P4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CenpfE9Q3P4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CenpfE9Q3P4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CenpfE9Q3P4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CenpfE9Q3P4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CenpfE9Q3P4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CenpfE9Q3P4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CenpfE9Q3P4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CenpfE9Q3P4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CenpfE9Q3P4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CenpfE9Q3P4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CenpfE9Q3P4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CenpfE9Q3P4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CenpfE9Q3P4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CenpfE9Q3P4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CenpfE9Q3P4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CenpfE9Q3P4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CenpfE9Q3P4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms