Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r238E9Q373 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r238E9Q373 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vmn1r238E9Q373 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn1r238E9Q373 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn1r238E9Q373 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn1r238E9Q373 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn1r238E9Q373 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn1r238E9Q373 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Vmn1r238E9Q373 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vmn1r238E9Q373 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms