Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Fndc1E9Q043 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Fndc1E9Q043 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Fndc1E9Q043 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Fndc1E9Q043 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Fndc1E9Q043 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Fndc1E9Q043 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Fndc1E9Q043 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Fndc1E9Q043 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Fndc1E9Q043 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Fndc1E9Q043 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Fndc1E9Q043 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Fndc1E9Q043 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Fndc1E9Q043 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Fndc1E9Q043 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Fndc1E9Q043 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Fndc1E9Q043 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Fndc1E9Q043 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Fndc1E9Q043 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Fndc1E9Q043 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Fndc1E9Q043 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Fndc1E9Q043 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Fndc1E9Q043 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Fndc1E9Q043 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Fndc1E9Q043 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Fndc1E9Q043 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Fndc1E9Q043 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Fndc1E9Q043 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Fndc1E9Q043 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Fndc1E9Q043 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Fndc1E9Q043 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fndc1E9Q043 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fndc1E9Q043 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fndc1E9Q043 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fndc1E9Q043 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Fndc1E9Q043 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fndc1E9Q043 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fndc1E9Q043 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fndc1E9Q043 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fndc1E9Q043 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Fndc1E9Q043 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Fndc1E9Q043 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fndc1E9Q043 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fndc1E9Q043 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fndc1E9Q043 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fndc1E9Q043 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Fndc1E9Q043 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fndc1E9Q043 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fndc1E9Q043 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fndc1E9Q043 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fndc1E9Q043 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fndc1E9Q043 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fndc1E9Q043 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fndc1E9Q043 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fndc1E9Q043 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fndc1E9Q043 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fndc1E9Q043 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Fndc1E9Q043 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fndc1E9Q043 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fndc1E9Q043 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fndc1E9Q043 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fndc1E9Q043 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fndc1E9Q043 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fndc1E9Q043 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Fndc1E9Q043 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fndc1E9Q043 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fndc1E9Q043 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Fndc1E9Q043 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fndc1E9Q043 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fndc1E9Q043 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fndc1E9Q043 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fndc1E9Q043 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fndc1E9Q043 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Fndc1E9Q043 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Fndc1E9Q043 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Fndc1E9Q043 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Fndc1E9Q043 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Fndc1E9Q043 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Fndc1E9Q043 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Fndc1E9Q043 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.4 ms