Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Scaf11E9PZM7 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Scaf11E9PZM7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Scaf11E9PZM7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Scaf11E9PZM7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Scaf11E9PZM7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Scaf11E9PZM7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Scaf11E9PZM7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Scaf11E9PZM7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Scaf11E9PZM7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Scaf11E9PZM7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Scaf11E9PZM7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Scaf11E9PZM7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Scaf11E9PZM7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Scaf11E9PZM7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Scaf11E9PZM7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Scaf11E9PZM7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Scaf11E9PZM7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Scaf11E9PZM7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Scaf11E9PZM7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Scaf11E9PZM7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Scaf11E9PZM7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Scaf11E9PZM7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Scaf11E9PZM7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Scaf11E9PZM7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Scaf11E9PZM7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Scaf11E9PZM7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Scaf11E9PZM7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Scaf11E9PZM7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Scaf11E9PZM7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Scaf11E9PZM7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Scaf11E9PZM7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Scaf11E9PZM7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Scaf11E9PZM7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Scaf11E9PZM7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Scaf11E9PZM7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Scaf11E9PZM7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Scaf11E9PZM7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Scaf11E9PZM7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Scaf11E9PZM7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Scaf11E9PZM7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Scaf11E9PZM7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Scaf11E9PZM7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Scaf11E9PZM7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Scaf11E9PZM7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Scaf11E9PZM7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Scaf11E9PZM7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Scaf11E9PZM7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Scaf11E9PZM7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms