Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T8

4930407I10Rik, RIKEN cDNA 4930407I10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930407I10RikD3Z5T8 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
4930407I10RikD3Z5T8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
4930407I10RikD3Z5T8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
4930407I10RikD3Z5T8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
4930407I10RikD3Z5T8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
4930407I10RikD3Z5T8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
4930407I10RikD3Z5T8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
4930407I10RikD3Z5T8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
4930407I10RikD3Z5T8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
4930407I10RikD3Z5T8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
4930407I10RikD3Z5T8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
4930407I10RikD3Z5T8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
4930407I10RikD3Z5T8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
4930407I10RikD3Z5T8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
4930407I10RikD3Z5T8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
4930407I10RikD3Z5T8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
4930407I10RikD3Z5T8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
4930407I10RikD3Z5T8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
4930407I10RikD3Z5T8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
4930407I10RikD3Z5T8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
4930407I10RikD3Z5T8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
4930407I10RikD3Z5T8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
4930407I10RikD3Z5T8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
4930407I10RikD3Z5T8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
4930407I10RikD3Z5T8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
4930407I10RikD3Z5T8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
4930407I10RikD3Z5T8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
4930407I10RikD3Z5T8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
4930407I10RikD3Z5T8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
4930407I10RikD3Z5T8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
4930407I10RikD3Z5T8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
4930407I10RikD3Z5T8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
4930407I10RikD3Z5T8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
4930407I10RikD3Z5T8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
4930407I10RikD3Z5T8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
4930407I10RikD3Z5T8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
4930407I10RikD3Z5T8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
4930407I10RikD3Z5T8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
4930407I10RikD3Z5T8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
4930407I10RikD3Z5T8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
4930407I10RikD3Z5T8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
4930407I10RikD3Z5T8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
4930407I10RikD3Z5T8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
4930407I10RikD3Z5T8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
4930407I10RikD3Z5T8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
4930407I10RikD3Z5T8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
4930407I10RikD3Z5T8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
4930407I10RikD3Z5T8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
4930407I10RikD3Z5T8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
4930407I10RikD3Z5T8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
4930407I10RikD3Z5T8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
4930407I10RikD3Z5T8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
4930407I10RikD3Z5T8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
4930407I10RikD3Z5T8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
4930407I10RikD3Z5T8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
4930407I10RikD3Z5T8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
4930407I10RikD3Z5T8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
4930407I10RikD3Z5T8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
4930407I10RikD3Z5T8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
4930407I10RikD3Z5T8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
4930407I10RikD3Z5T8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
4930407I10RikD3Z5T8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
4930407I10RikD3Z5T8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
4930407I10RikD3Z5T8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
4930407I10RikD3Z5T8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
4930407I10RikD3Z5T8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
4930407I10RikD3Z5T8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
4930407I10RikD3Z5T8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
4930407I10RikD3Z5T8 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
4930407I10RikD3Z5T8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
4930407I10RikD3Z5T8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
4930407I10RikD3Z5T8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
4930407I10RikD3Z5T8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
4930407I10RikD3Z5T8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
4930407I10RikD3Z5T8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
4930407I10RikD3Z5T8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
4930407I10RikD3Z5T8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
4930407I10RikD3Z5T8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
4930407I10RikD3Z5T8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
4930407I10RikD3Z5T8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
4930407I10RikD3Z5T8 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
4930407I10RikD3Z5T8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
4930407I10RikD3Z5T8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
4930407I10RikD3Z5T8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
4930407I10RikD3Z5T8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
4930407I10RikD3Z5T8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
4930407I10RikD3Z5T8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
4930407I10RikD3Z5T8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
4930407I10RikD3Z5T8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
4930407I10RikD3Z5T8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
4930407I10RikD3Z5T8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
4930407I10RikD3Z5T8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
4930407I10RikD3Z5T8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
4930407I10RikD3Z5T8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
4930407I10RikD3Z5T8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
4930407I10RikD3Z5T8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
4930407I10RikD3Z5T8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
4930407I10RikD3Z5T8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
4930407I10RikD3Z5T8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms