Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L6

Slc18b1, MFS-type transporter SLC18B1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18b1D3Z5L6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc18b1D3Z5L6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc18b1D3Z5L6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc18b1D3Z5L6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc18b1D3Z5L6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc18b1D3Z5L6 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc18b1D3Z5L6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc18b1D3Z5L6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc18b1D3Z5L6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc18b1D3Z5L6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc18b1D3Z5L6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc18b1D3Z5L6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc18b1D3Z5L6 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc18b1D3Z5L6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc18b1D3Z5L6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc18b1D3Z5L6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc18b1D3Z5L6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc18b1D3Z5L6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc18b1D3Z5L6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc18b1D3Z5L6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc18b1D3Z5L6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc18b1D3Z5L6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc18b1D3Z5L6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc18b1D3Z5L6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc18b1D3Z5L6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc18b1D3Z5L6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc18b1D3Z5L6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc18b1D3Z5L6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc18b1D3Z5L6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc18b1D3Z5L6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc18b1D3Z5L6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc18b1D3Z5L6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc18b1D3Z5L6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc18b1D3Z5L6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc18b1D3Z5L6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc18b1D3Z5L6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc18b1D3Z5L6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc18b1D3Z5L6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc18b1D3Z5L6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc18b1D3Z5L6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc18b1D3Z5L6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc18b1D3Z5L6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc18b1D3Z5L6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc18b1D3Z5L6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Slc18b1D3Z5L6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc18b1D3Z5L6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc18b1D3Z5L6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Slc18b1D3Z5L6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc18b1D3Z5L6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc18b1D3Z5L6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc18b1D3Z5L6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc18b1D3Z5L6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc18b1D3Z5L6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc18b1D3Z5L6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc18b1D3Z5L6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc18b1D3Z5L6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc18b1D3Z5L6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc18b1D3Z5L6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc18b1D3Z5L6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc18b1D3Z5L6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc18b1D3Z5L6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc18b1D3Z5L6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc18b1D3Z5L6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Slc18b1D3Z5L6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc18b1D3Z5L6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc18b1D3Z5L6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc18b1D3Z5L6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc18b1D3Z5L6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc18b1D3Z5L6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc18b1D3Z5L6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc18b1D3Z5L6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc18b1D3Z5L6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc18b1D3Z5L6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc18b1D3Z5L6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc18b1D3Z5L6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc18b1D3Z5L6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc18b1D3Z5L6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc18b1D3Z5L6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc18b1D3Z5L6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc18b1D3Z5L6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc18b1D3Z5L6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc18b1D3Z5L6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc18b1D3Z5L6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc18b1D3Z5L6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Slc18b1D3Z5L6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc18b1D3Z5L6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc18b1D3Z5L6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc18b1D3Z5L6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc18b1D3Z5L6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc18b1D3Z5L6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc18b1D3Z5L6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc18b1D3Z5L6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc18b1D3Z5L6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc18b1D3Z5L6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc18b1D3Z5L6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc18b1D3Z5L6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc18b1D3Z5L6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc18b1D3Z5L6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc18b1D3Z5L6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Slc18b1D3Z5L6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms