Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms