Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc6D3YZP9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc6D3YZP9 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms