Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmf1B9EKI3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmf1B9EKI3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmf1B9EKI3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmf1B9EKI3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmf1B9EKI3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmf1B9EKI3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmf1B9EKI3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmf1B9EKI3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmf1B9EKI3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmf1B9EKI3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmf1B9EKI3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmf1B9EKI3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmf1B9EKI3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmf1B9EKI3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmf1B9EKI3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmf1B9EKI3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmf1B9EKI3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmf1B9EKI3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmf1B9EKI3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmf1B9EKI3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmf1B9EKI3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmf1B9EKI3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmf1B9EKI3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmf1B9EKI3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmf1B9EKI3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmf1B9EKI3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmf1B9EKI3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
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