Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Cttnbp2B9EJA2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Cttnbp2B9EJA2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Cttnbp2B9EJA2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Cttnbp2B9EJA2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Cttnbp2B9EJA2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Cttnbp2B9EJA2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Cttnbp2B9EJA2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Cttnbp2B9EJA2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Cttnbp2B9EJA2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Cttnbp2B9EJA2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Cttnbp2B9EJA2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
Cttnbp2B9EJA2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Cttnbp2B9EJA2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Cttnbp2B9EJA2 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Cttnbp2B9EJA2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Cttnbp2B9EJA2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Cttnbp2B9EJA2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Cttnbp2B9EJA2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
Cttnbp2B9EJA2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Cttnbp2B9EJA2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Cttnbp2B9EJA2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Cttnbp2B9EJA2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Cttnbp2B9EJA2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Cttnbp2B9EJA2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
Cttnbp2B9EJA2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
Cttnbp2B9EJA2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Cttnbp2B9EJA2 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Cttnbp2B9EJA2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Cttnbp2B9EJA2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
Cttnbp2B9EJA2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Cttnbp2B9EJA2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Cttnbp2B9EJA2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Cttnbp2B9EJA2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Cttnbp2B9EJA2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Cttnbp2B9EJA2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Cttnbp2B9EJA2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Cttnbp2B9EJA2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Cttnbp2B9EJA2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Cttnbp2B9EJA2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Cttnbp2B9EJA2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Cttnbp2B9EJA2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Cttnbp2B9EJA2 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Cttnbp2B9EJA2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Cttnbp2B9EJA2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Cttnbp2B9EJA2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Cttnbp2B9EJA2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Cttnbp2B9EJA2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
Cttnbp2B9EJA2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Cttnbp2B9EJA2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Cttnbp2B9EJA2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Cttnbp2B9EJA2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Cttnbp2B9EJA2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Cttnbp2B9EJA2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Cttnbp2B9EJA2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Cttnbp2B9EJA2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Cttnbp2B9EJA2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Cttnbp2B9EJA2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Cttnbp2B9EJA2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Cttnbp2B9EJA2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Cttnbp2B9EJA2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Cttnbp2B9EJA2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Cttnbp2B9EJA2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Cttnbp2B9EJA2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Cttnbp2B9EJA2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Cttnbp2B9EJA2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Cttnbp2B9EJA2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Cttnbp2B9EJA2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Cttnbp2B9EJA2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Cttnbp2B9EJA2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Cttnbp2B9EJA2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Cttnbp2B9EJA2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Cttnbp2B9EJA2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Cttnbp2B9EJA2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Cttnbp2B9EJA2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
Cttnbp2B9EJA2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Cttnbp2B9EJA2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Cttnbp2B9EJA2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Cttnbp2B9EJA2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Cttnbp2B9EJA2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Cttnbp2B9EJA2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Cttnbp2B9EJA2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Cttnbp2B9EJA2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
Cttnbp2B9EJA2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
Cttnbp2B9EJA2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Cttnbp2B9EJA2 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
Cttnbp2B9EJA2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Cttnbp2B9EJA2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Cttnbp2B9EJA2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Cttnbp2B9EJA2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Cttnbp2B9EJA2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Cttnbp2B9EJA2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Cttnbp2B9EJA2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Cttnbp2B9EJA2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Cttnbp2B9EJA2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
Cttnbp2B9EJA2 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Cttnbp2B9EJA2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms