Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Pdzd8B9EJ80 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Pdzd8B9EJ80 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdzd8B9EJ80 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdzd8B9EJ80 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdzd8B9EJ80 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdzd8B9EJ80 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdzd8B9EJ80 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdzd8B9EJ80 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdzd8B9EJ80 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Pdzd8B9EJ80 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms