Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Zscan5bB2RTN3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Zscan5bB2RTN3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms