Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rhox1B1APN4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rhox1B1APN4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rhox1B1APN4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rhox1B1APN4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhox1B1APN4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhox1B1APN4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhox1B1APN4 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhox1B1APN4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhox1B1APN4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhox1B1APN4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhox1B1APN4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhox1B1APN4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhox1B1APN4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhox1B1APN4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhox1B1APN4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhox1B1APN4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhox1B1APN4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhox1B1APN4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhox1B1APN4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rhox1B1APN4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhox1B1APN4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhox1B1APN4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhox1B1APN4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhox1B1APN4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhox1B1APN4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhox1B1APN4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhox1B1APN4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhox1B1APN4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhox1B1APN4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhox1B1APN4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhox1B1APN4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhox1B1APN4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rhox1B1APN4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhox1B1APN4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhox1B1APN4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhox1B1APN4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhox1B1APN4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhox1B1APN4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhox1B1APN4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rhox1B1APN4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms