Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
H2-M5A7VMS3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M5A7VMS3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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