Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Prr16A3KMN5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prr16A3KMN5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prr16A3KMN5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prr16A3KMN5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Prr16A3KMN5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prr16A3KMN5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prr16A3KMN5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prr16A3KMN5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prr16A3KMN5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prr16A3KMN5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prr16A3KMN5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prr16A3KMN5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prr16A3KMN5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prr16A3KMN5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prr16A3KMN5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prr16A3KMN5 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prr16A3KMN5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prr16A3KMN5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prr16A3KMN5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prr16A3KMN5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prr16A3KMN5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prr16A3KMN5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Prr16A3KMN5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prr16A3KMN5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prr16A3KMN5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prr16A3KMN5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prr16A3KMN5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prr16A3KMN5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prr16A3KMN5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prr16A3KMN5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms