Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp8b5A3FIN4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp8b5A3FIN4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp8b5A3FIN4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp8b5A3FIN4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp8b5A3FIN4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp8b5A3FIN4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp8b5A3FIN4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Atp8b5A3FIN4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Atp8b5A3FIN4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Atp8b5A3FIN4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Atp8b5A3FIN4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Atp8b5A3FIN4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atp8b5A3FIN4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atp8b5A3FIN4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atp8b5A3FIN4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp8b5A3FIN4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp8b5A3FIN4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp8b5A3FIN4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp8b5A3FIN4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atp8b5A3FIN4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp8b5A3FIN4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp8b5A3FIN4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp8b5A3FIN4 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp8b5A3FIN4 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp8b5A3FIN4 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp8b5A3FIN4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atp8b5A3FIN4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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