Protein–RNA interactions for Protein: A2AX52

Col6a4, Collagen alpha-4(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a4A2AX52 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a4A2AX52 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a4A2AX52 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a4A2AX52 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a4A2AX52 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a4A2AX52 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a4A2AX52 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a4A2AX52 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a4A2AX52 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a4A2AX52 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a4A2AX52 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a4A2AX52 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a4A2AX52 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Col6a4A2AX52 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a4A2AX52 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a4A2AX52 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a4A2AX52 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a4A2AX52 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a4A2AX52 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a4A2AX52 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a4A2AX52 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a4A2AX52 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a4A2AX52 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a4A2AX52 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a4A2AX52 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a4A2AX52 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a4A2AX52 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a4A2AX52 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a4A2AX52 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a4A2AX52 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a4A2AX52 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Col6a4A2AX52 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a4A2AX52 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a4A2AX52 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a4A2AX52 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a4A2AX52 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a4A2AX52 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a4A2AX52 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a4A2AX52 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a4A2AX52 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a4A2AX52 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a4A2AX52 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a4A2AX52 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a4A2AX52 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a4A2AX52 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a4A2AX52 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a4A2AX52 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a4A2AX52 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a4A2AX52 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a4A2AX52 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Col6a4A2AX52 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col6a4A2AX52 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col6a4A2AX52 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Col6a4A2AX52 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Col6a4A2AX52 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col6a4A2AX52 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms