Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GabreA2AMW3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GabreA2AMW3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms