Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc183A2AJB1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc183A2AJB1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc183A2AJB1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms