Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prdm2A2A7B5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prdm2A2A7B5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Prdm2A2A7B5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prdm2A2A7B5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prdm2A2A7B5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prdm2A2A7B5 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Prdm2A2A7B5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Prdm2A2A7B5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Prdm2A2A7B5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Prdm2A2A7B5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prdm2A2A7B5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prdm2A2A7B5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Prdm2A2A7B5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prdm2A2A7B5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prdm2A2A7B5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prdm2A2A7B5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prdm2A2A7B5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prdm2A2A7B5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prdm2A2A7B5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prdm2A2A7B5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prdm2A2A7B5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prdm2A2A7B5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prdm2A2A7B5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prdm2A2A7B5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prdm2A2A7B5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prdm2A2A7B5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prdm2A2A7B5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prdm2A2A7B5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prdm2A2A7B5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prdm2A2A7B5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prdm2A2A7B5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prdm2A2A7B5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prdm2A2A7B5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prdm2A2A7B5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prdm2A2A7B5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prdm2A2A7B5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prdm2A2A7B5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Prdm2A2A7B5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prdm2A2A7B5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms