Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trav12-2A0N8N6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trav12-2A0N8N6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms