Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Myo18a-209ENSMUST00000108376 7374 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Slc37a2-202ENSMUST00000161114 2945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Gm37250-201ENSMUST00000194919 2388 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Acot12-201ENSMUST00000022120 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Fam227a-203ENSMUST00000109648 5187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Zfp111-201ENSMUST00000056683 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Sec31b-202ENSMUST00000111985 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Gm14459-201ENSMUST00000115573 540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Gm7091-201ENSMUST00000116438 586 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Ccpg1os-201ENSMUST00000124565 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 1700049E15Rik-202ENSMUST00000152737 921 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Gm27956-201ENSMUST00000175604 260 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 1700063H06Rik-201ENSMUST00000183678 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Gm17764-201ENSMUST00000185925 391 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Gm6123-201ENSMUST00000193658 1069 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Gm33973-201ENSMUST00000195148 534 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Iglc1-201ENSMUST00000200568 454 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Gm35037-201ENSMUST00000203144 506 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Gm2676-201ENSMUST00000207279 606 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Gm31432-201ENSMUST00000214727 538 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Olfr1240-201ENSMUST00000215362 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Gm18972-201ENSMUST00000218873 630 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Gm36423-204ENSMUST00000222446 541 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 AC154472.1-201ENSMUST00000222663 236 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Glt8d2-202ENSMUST00000065815 1240 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Gm17541-201ENSMUST00000080062 525 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Rp1l1-201ENSMUST00000058229 6684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 P2rx7-204ENSMUST00000121489 2576 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 9930022D16Rik-201ENSMUST00000055404 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 March6-201ENSMUST00000090227 6260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Sardh-202ENSMUST00000102886 4521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Ncam1-202ENSMUST00000166811 3088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Ctsl-205ENSMUST00000222517 6168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 AC122878.1-201ENSMUST00000227716 1460 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Retsat-201ENSMUST00000070597 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Gm45786-201ENSMUST00000213021 2278 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Zscan21-202ENSMUST00000080732 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Gm6614-201ENSMUST00000111832 1953 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 AC102369.2-201ENSMUST00000219725 1679 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Sept11-207ENSMUST00000202217 1380 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Gm44689-201ENSMUST00000208786 1372 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Zfp7-201ENSMUST00000023179 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Srp54b-201ENSMUST00000164243 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Btn1a1-201ENSMUST00000041674 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Gm44510-201ENSMUST00000206288 4532 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Cacna1c-220ENSMUST00000189520 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Sla2-201ENSMUST00000029164 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Gm13128-201ENSMUST00000105751 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Gm42653-201ENSMUST00000200644 2839 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Ctnnd1-205ENSMUST00000111670 5047 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Etv5-203ENSMUST00000168774 3773 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Gm37125-201ENSMUST00000195877 1559 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Smok2b-201ENSMUST00000059824 1584 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Prg4-202ENSMUST00000111901 3495 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Tex52-202ENSMUST00000130785 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 CT033774.1-201ENSMUST00000223084 2394 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Tomm20-201ENSMUST00000179857 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Gm12611-201ENSMUST00000119452 1037 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Serf1-202ENSMUST00000129014 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 1700129C05Rik-204ENSMUST00000162674 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Gm20463-201ENSMUST00000174756 366 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Gm26871-203ENSMUST00000181060 355 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Riok3Q9DBU3 Gm26834-201ENSMUST00000181815 950 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms