Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Ranbp9-208ENSMUST00000222651 1951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Gm42981-201ENSMUST00000200184 3252 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Sap30bp-203ENSMUST00000140991 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Htt-201ENSMUST00000080036 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Rnf219-201ENSMUST00000022716 3420 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Gm37334-201ENSMUST00000192325 2938 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb18-206ENSMUST00000193480 3734 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Gm20539-201ENSMUST00000174811 1384 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Magea5-201ENSMUST00000069556 1360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Zfp37-201ENSMUST00000068822 3494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Rnf141-209ENSMUST00000177236 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Zcwpw2-201ENSMUST00000111769 1505 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 St6galnac3-204ENSMUST00000200397 8169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Lrcol1-201ENSMUST00000100924 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Ighv5-12-201ENSMUST00000103450 353 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Gm25761-201ENSMUST00000103983 128 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Sult2a7-201ENSMUST00000108524 897 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Clec4n-202ENSMUST00000112554 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 1700015F17Rik-201ENSMUST00000115447 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Gm12985-201ENSMUST00000118376 183 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Gm4773-201ENSMUST00000120392 702 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Gm13218-201ENSMUST00000128180 265 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Gm11722-201ENSMUST00000138702 534 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Myl2-201ENSMUST00000014080 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Samd13-204ENSMUST00000147113 729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Fpr2-202ENSMUST00000149944 883 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Gm24236-201ENSMUST00000157794 134 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Gm23897-201ENSMUST00000158110 158 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Gm22202-201ENSMUST00000158608 311 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Mir3085-201ENSMUST00000175493 89 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Snhg7-201ENSMUST00000181621 139 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Gm7734-201ENSMUST00000182832 1011 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Gm27197-201ENSMUST00000184325 479 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Gm28652-201ENSMUST00000187008 599 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 1700006F04Rik-201ENSMUST00000188582 441 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Gm43743-201ENSMUST00000197898 697 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Clec4n-206ENSMUST00000205129 363 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Gm45155-201ENSMUST00000207365 596 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Gm44869-201ENSMUST00000208836 357 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Gm34853-201ENSMUST00000211662 509 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Sult2a7-204ENSMUST00000211740 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Olfr258-ps1-202ENSMUST00000218625 1085 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 AC138330.1-201ENSMUST00000220690 1127 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 AC154249.1-201ENSMUST00000226296 320 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Mettl21c-201ENSMUST00000061421 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Cst7-201ENSMUST00000089200 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1055-201ENSMUST00000099894 1182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Cnot2-204ENSMUST00000164088 2618 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 1700095J07Rik-201ENSMUST00000128017 1405 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Sh3kbp1-205ENSMUST00000112453 2515 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Gm45001-201ENSMUST00000208279 2515 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Mr1-201ENSMUST00000027744 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Vmn2r40-201ENSMUST00000171942 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Olfr381-204ENSMUST00000215358 2658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Tgfbr1-203ENSMUST00000107725 1713 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Usp15-201ENSMUST00000020334 4666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Gm34184-201ENSMUST00000216477 2713 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 4833427F10Rik-201ENSMUST00000172874 1475 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Arfgef1-201ENSMUST00000088615 6978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Gm43980-201ENSMUST00000204899 1612 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Zfp68-202ENSMUST00000085852 3318 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Olfr45-202ENSMUST00000214637 6157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Cs-201ENSMUST00000005826 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Trp63-205ENSMUST00000115306 4691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Gucy1b2-203ENSMUST00000165651 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Gm20531-201ENSMUST00000174861 1373 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 AC158981.2-201ENSMUST00000227565 1537 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Crtam-202ENSMUST00000180384 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Cntrl-204ENSMUST00000113033 1817 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Tnfsf4-201ENSMUST00000028024 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Hspg2-203ENSMUST00000171332 14176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Gm38251-201ENSMUST00000192968 2575 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Gas2l3-201ENSMUST00000099374 6748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Olfr455-202ENSMUST00000217978 4054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc127-201ENSMUST00000022063 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Olfr1183-202ENSMUST00000213115 8258 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Bcas3-204ENSMUST00000108056 2925 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Orc2-202ENSMUST00000114325 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Gm6654-201ENSMUST00000118950 348 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Gm16150-201ENSMUST00000127620 437 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Gm17235-201ENSMUST00000169128 964 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Gm19705-204ENSMUST00000181524 413 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 6530403H02Rik-201ENSMUST00000182099 402 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Gm7132-201ENSMUST00000182302 984 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 1700124L16Rik-203ENSMUST00000190077 1110 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Gm19002-201ENSMUST00000192649 1012 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 1600020E01Rik-203ENSMUST00000204008 713 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Gm39662-201ENSMUST00000211909 1227 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 AC131667.1-201ENSMUST00000214665 2175 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 AC158239.1-201ENSMUST00000216890 779 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 CT009556.2-201ENSMUST00000227980 1123 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Ints4-201ENSMUST00000026126 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Eqtn-201ENSMUST00000030309 1074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Oard1-201ENSMUST00000046651 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Ccdc97Q9DBT3 Rps7-201ENSMUST00000074267 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.1 ms