Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 0610037L13Rik-204ENSMUST00000106727 926 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Gm5406-201ENSMUST00000120054 766 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Gm16420-201ENSMUST00000120258 856 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Gm11440-201ENSMUST00000121509 527 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Gm13389-201ENSMUST00000142774 639 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Trbv9-201ENSMUST00000194494 290 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Ighv1-21-201ENSMUST00000194856 351 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Gm40040-201ENSMUST00000196123 504 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 1600020E01Rik-203ENSMUST00000204008 713 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Gm45319-201ENSMUST00000210220 318 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 AC164550.1-201ENSMUST00000217821 1066 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 AC157571.1-201ENSMUST00000222014 520 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 AC157572.1-201ENSMUST00000227187 825 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 AC102676.1-201ENSMUST00000228131 719 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Ino80c-201ENSMUST00000055012 909 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Trex1-201ENSMUST00000061973 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Olfr298-201ENSMUST00000077800 999 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Cnot2-209ENSMUST00000167706 1621 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Oog4-201ENSMUST00000061277 1981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Pax3-202ENSMUST00000087086 3863 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Fchsd2-201ENSMUST00000032931 4453 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Cnr1-202ENSMUST00000084736 5761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Adgrb3-205ENSMUST00000135518 5432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Ano3-201ENSMUST00000099623 6705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 F930017D23Rik-202ENSMUST00000213342 2141 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Krit1-202ENSMUST00000171023 5582 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Spred1-202ENSMUST00000110901 1440 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Gm42435-201ENSMUST00000196630 1448 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Papola-215ENSMUST00000170002 2605 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Lrrtm4-205ENSMUST00000133918 2255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Gm45902-201ENSMUST00000124331 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Cep85-202ENSMUST00000121566 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Gpnmb-201ENSMUST00000031840 3701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Sox6-202ENSMUST00000106612 8193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Gm28055-202ENSMUST00000189576 1301 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Rnf125-201ENSMUST00000050004 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Nfat5-214ENSMUST00000169453 13380 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Olfr1394-202ENSMUST00000216273 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Nipsnap3a-202ENSMUST00000107666 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Xiap-204ENSMUST00000115095 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Maml2-201ENSMUST00000034401 2098 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Gm9125-202ENSMUST00000180746 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Gm9117-202ENSMUST00000193529 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Gm21129-201ENSMUST00000185932 2560 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Gm29258-201ENSMUST00000186842 2564 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Gm6729-201ENSMUST00000165173 1452 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 AC107757.2-201ENSMUST00000226370 1466 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Ugt1a6b-201ENSMUST00000113137 2249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Gabrb3-202ENSMUST00000085240 5712 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Ptprj-201ENSMUST00000111493 7124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Gm13619-201ENSMUST00000155722 2138 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Olfr727-202ENSMUST00000215317 2616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 A130012E19Rik-201ENSMUST00000218674 3135 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Zfp40-201ENSMUST00000037057 4103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Siae-204ENSMUST00000215474 4947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Adgrl2-202ENSMUST00000106128 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Selenop-201ENSMUST00000082424 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Cacna1c-207ENSMUST00000186889 13162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Lama3-202ENSMUST00000188815 5551 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Pafah2-202ENSMUST00000105870 3180 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Olfr1396-202ENSMUST00000109201 1170 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Gm14328-201ENSMUST00000122178 408 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Rpl37rt-202ENSMUST00000124641 294 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Gm14764-201ENSMUST00000147130 313 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Gm15389-201ENSMUST00000153774 666 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Gm25372-201ENSMUST00000158161 255 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Gm4781-201ENSMUST00000167995 781 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Gm17205-201ENSMUST00000168370 1207 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Gm17979-201ENSMUST00000196646 611 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Gm3103-201ENSMUST00000198073 752 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Olfr1294-201ENSMUST00000208334 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Gm44743-201ENSMUST00000209062 386 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 CT030260.1-201ENSMUST00000223243 442 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 AC152940.1-201ENSMUST00000226504 139 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Ccdc150-201ENSMUST00000027128 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Defb3-201ENSMUST00000033852 275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Gm2531-201ENSMUST00000075609 512 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Gm24411-201ENSMUST00000083428 131 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Dcaf1-201ENSMUST00000055009 4967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Ctnnd1-208ENSMUST00000111677 5789 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Cfap43-205ENSMUST00000160247 5264 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Gm9929-201ENSMUST00000171747 1671 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Pgbd1-202ENSMUST00000122872 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Cyp2b19-201ENSMUST00000077855 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Gm37403-201ENSMUST00000193775 3521 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Akap13-201ENSMUST00000166315 12543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 AC122356.1-202ENSMUST00000227328 2758 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Pclo-201ENSMUST00000030691 20084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Fer1l6-203ENSMUST00000161028 5714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Rapgef5-205ENSMUST00000222105 2677 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 Rnase4-202ENSMUST00000169895 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SrrdQ8K2M3 1810011H11Rik-201ENSMUST00000039191 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.5 ms