Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm6072-201ENSMUST00000203989 496 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 AC153948.2-201ENSMUST00000218112 505 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm36862-202ENSMUST00000222758 1051 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm4257-201ENSMUST00000222877 513 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 AC163667.2-201ENSMUST00000223769 791 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Rps29-201ENSMUST00000037023 390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Mrps36-ps1-201ENSMUST00000061311 306 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Olfr770-201ENSMUST00000062314 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 5031410I06Rik-201ENSMUST00000063524 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm7347-201ENSMUST00000095004 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm42653-201ENSMUST00000200644 2839 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Adgb-204ENSMUST00000172530 5215 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Cldn12-202ENSMUST00000115445 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm20609-201ENSMUST00000177104 1527 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Abi1-202ENSMUST00000091394 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Nckap5-201ENSMUST00000057846 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm8113-201ENSMUST00000160298 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r40-201ENSMUST00000171942 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Hspa13-202ENSMUST00000114244 2674 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm42766-201ENSMUST00000200233 1332 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 AC112680.1-201ENSMUST00000215435 1349 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm37653-201ENSMUST00000195401 3578 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Olfr449-202ENSMUST00000204072 1974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm2654-201ENSMUST00000221381 1592 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm18901-201ENSMUST00000197840 1444 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm5903-201ENSMUST00000121836 2325 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm33148-201ENSMUST00000210835 7227 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Myl7-201ENSMUST00000102921 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc50-ps-201ENSMUST00000118044 941 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Speer4d-202ENSMUST00000119100 857 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 H3f3a-ps1-201ENSMUST00000119546 410 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm11198-201ENSMUST00000119771 974 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm12206-201ENSMUST00000119795 601 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm12754-201ENSMUST00000121908 454 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm12634-201ENSMUST00000122157 992 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Mir1907-201ENSMUST00000122509 90 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm10086-201ENSMUST00000136334 354 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm23827-201ENSMUST00000157116 145 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm5698-201ENSMUST00000178317 724 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm21976-202ENSMUST00000180066 831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 1700009C05Rik-201ENSMUST00000191101 788 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm38145-201ENSMUST00000192319 693 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm8388-201ENSMUST00000193000 756 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm42667-201ENSMUST00000196132 234 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Tial1-214ENSMUST00000205835 562 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm32567-201ENSMUST00000211244 682 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Olfr882-ps1-201ENSMUST00000211842 450 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 4930550C14Rik-204ENSMUST00000217318 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 AC156576.3-201ENSMUST00000221940 452 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 AC207128.2-202ENSMUST00000224010 808 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 AC170810.2-201ENSMUST00000228384 1232 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gsta2-201ENSMUST00000034902 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 2410137M14Rik-201ENSMUST00000039846 865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 BC048562-201ENSMUST00000057265 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm6505-201ENSMUST00000094335 648 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
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Sft2d1Q5SSN7 Kyat3-202ENSMUST00000106218 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Platr22-201ENSMUST00000181274 1617 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Serpina1d-201ENSMUST00000078869 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Hsf2-201ENSMUST00000079833 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Cyld-202ENSMUST00000098519 7954 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Sin3a-201ENSMUST00000049169 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Lcp1-209ENSMUST00000145303 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Sema6d-205ENSMUST00000103238 3165 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Golph3l-201ENSMUST00000060323 2652 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Zfp207-202ENSMUST00000053740 1562 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 9230102K24Rik-201ENSMUST00000219459 1303 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Olfr259-203ENSMUST00000215828 4095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Enpp2-204ENSMUST00000173516 2887 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Nedd9-201ENSMUST00000021794 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm43869-201ENSMUST00000204742 1405 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 AC129085.2-201ENSMUST00000223763 2800 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1504-202ENSMUST00000209192 1514 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm18508-201ENSMUST00000215790 1642 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm27509-201ENSMUST00000102400 79 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm5228-201ENSMUST00000117186 357 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
Sft2d1Q5SSN7 Gm12851-201ENSMUST00000117920 421 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
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