Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Gm34653-201ENSMUST00000201786 1658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 AC154171.3-201ENSMUST00000224519 2505 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Rgs4-202ENSMUST00000111357 2575 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Creb5-202ENSMUST00000203487 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm37074-201ENSMUST00000193444 1843 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm3139-201ENSMUST00000178330 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm3183-201ENSMUST00000180076 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Grip1-211ENSMUST00000144959 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Dusp3-202ENSMUST00000107172 4445 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Csf3r-201ENSMUST00000030673 3160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm28649-201ENSMUST00000189153 1581 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Olfr743-202ENSMUST00000215793 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Igkv8-24-201ENSMUST00000103384 365 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 H3f3a-ps1-201ENSMUST00000119546 410 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm15644-201ENSMUST00000121764 387 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm13776-201ENSMUST00000122236 1261 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 4930415H17Rik-201ENSMUST00000122396 123 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Olfr819-201ENSMUST00000167974 963 ntAPPRIS P2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Olfr247-201ENSMUST00000170920 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm7341-201ENSMUST00000192183 926 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Olfr97-202ENSMUST00000207414 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm44554-201ENSMUST00000208738 147 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm9604-201ENSMUST00000211175 433 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 AC134859.1-201ENSMUST00000214085 721 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Npvf-201ENSMUST00000031853 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Kcne3-201ENSMUST00000049333 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Olfr384-201ENSMUST00000072993 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm10310-201ENSMUST00000095239 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Tdrd1-201ENSMUST00000078723 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm43775-201ENSMUST00000201019 3395 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Mynn-201ENSMUST00000047502 3394 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Cts7-203ENSMUST00000224986 1349 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Myom1-202ENSMUST00000073211 5602 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Lockd-201ENSMUST00000183867 5662 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm36993-201ENSMUST00000192983 2980 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Itgb6-203ENSMUST00000112517 3537 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Alms1-205ENSMUST00000213058 11163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Zfp935-202ENSMUST00000221747 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Vmn2r45-201ENSMUST00000164845 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 A730085K08Rik-201ENSMUST00000177015 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 4930532G15Rik-202ENSMUST00000195314 1457 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Zscan26-201ENSMUST00000032820 3918 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Sulf1-205ENSMUST00000186051 4563 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Thada-201ENSMUST00000047524 7884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Zscan4b-202ENSMUST00000210847 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 D430042O09Rik-201ENSMUST00000069660 6148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 AC158622.2-201ENSMUST00000217363 2552 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Cyfip2-202ENSMUST00000093166 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm35172-201ENSMUST00000196037 2649 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Cenpo-205ENSMUST00000140975 4348 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Fam214a-201ENSMUST00000081746 3795 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm10377-201ENSMUST00000100695 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm23437-201ENSMUST00000104036 127 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm3543-201ENSMUST00000111870 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm15105-201ENSMUST00000117777 204 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Mgst1-202ENSMUST00000118091 1030 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm5390-201ENSMUST00000119069 1230 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm13130-201ENSMUST00000119195 1166 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Mgst1-203ENSMUST00000120230 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm13724-201ENSMUST00000122395 1155 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm12720-201ENSMUST00000123834 472 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm16336-201ENSMUST00000126011 380 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm3573-201ENSMUST00000168673 898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm10376-202ENSMUST00000169756 900 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm23018-201ENSMUST00000177928 109 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm19791-201ENSMUST00000180398 859 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm27684-201ENSMUST00000183778 80 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm28580-201ENSMUST00000186767 88 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm37294-201ENSMUST00000193461 494 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm34583-203ENSMUST00000202586 454 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Smarca2-238ENSMUST00000208589 1054 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 AC122397.3-201ENSMUST00000227097 527 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 AC154640.3-201ENSMUST00000227492 846 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Cfap126-201ENSMUST00000027959 1034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Olfr632-203ENSMUST00000214711 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Meis1-209ENSMUST00000185131 3346 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Vmn1r26-203ENSMUST00000228070 4419 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Mbd4-201ENSMUST00000032469 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Tbcel-203ENSMUST00000125995 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Rgn-201ENSMUST00000023832 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 5430420F09Rik-201ENSMUST00000194956 1799 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 A730011C13Rik-202ENSMUST00000141787 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Asb14-201ENSMUST00000090337 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Cntnap2-205ENSMUST00000199100 6279 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm43196-201ENSMUST00000201762 2114 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Ptprr-201ENSMUST00000063470 3619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Ivd-201ENSMUST00000028807 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm17034-201ENSMUST00000168990 2229 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gtf3c2-210ENSMUST00000202639 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Tbc1d24-216ENSMUST00000202925 4216 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Gm35808-201ENSMUST00000204769 2602 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Grik2-201ENSMUST00000079751 2610 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Add2-209ENSMUST00000204059 8182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Ptpn3-201ENSMUST00000075637 6369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Puf60Q3UEB3 Sfmbt1-204ENSMUST00000227303 2960 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms