Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Olfr131-204ENSMUST00000216523 1714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Mak-201ENSMUST00000021792 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Oas2-201ENSMUST00000053909 3869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm13821-201ENSMUST00000202029 3201 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gcc2-207ENSMUST00000162041 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Tcf20-201ENSMUST00000048966 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm7134-201ENSMUST00000122296 2406 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Fblim1-201ENSMUST00000006381 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Ggact-202ENSMUST00000110679 686 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Apoa2-202ENSMUST00000111319 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Amelx-203ENSMUST00000112119 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Lipo4-201ENSMUST00000112511 1188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm15578-201ENSMUST00000117320 475 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm22025-201ENSMUST00000122734 302 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm15915-201ENSMUST00000147379 908 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm11551-201ENSMUST00000147438 410 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm7991-201ENSMUST00000168668 591 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm10012-202ENSMUST00000170379 372 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm6536-201ENSMUST00000171180 615 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Olfr760-ps1-201ENSMUST00000172563 748 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm21430-201ENSMUST00000182998 998 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm29290-201ENSMUST00000185385 597 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 4931428L18Rik-203ENSMUST00000187659 423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm28622-201ENSMUST00000189842 507 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm6522-201ENSMUST00000197160 1203 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm44577-201ENSMUST00000207413 1284 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 AC160966.1-203ENSMUST00000214689 1186 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 AC163354.2-201ENSMUST00000221741 649 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 AC160114.3-201ENSMUST00000222256 560 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gcnt2-204ENSMUST00000223570 335 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm20900-201ENSMUST00000078729 472 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm24696-201ENSMUST00000083878 134 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Rbms3-202ENSMUST00000068962 3320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Spata31d1a-202ENSMUST00000224469 1616 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm10706-201ENSMUST00000128327 1960 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm44669-201ENSMUST00000207774 1969 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm15731-201ENSMUST00000146887 2195 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Pdgfd-203ENSMUST00000214892 2862 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Ctnna2-202ENSMUST00000159626 3908 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Lockd-201ENSMUST00000183867 5662 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 A730085K08Rik-201ENSMUST00000177015 2013 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm11639-201ENSMUST00000148007 3613 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm37706-201ENSMUST00000195379 2765 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Ehbp1-207ENSMUST00000180360 4971 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Zfp85os-201ENSMUST00000049518 2624 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Ankrd27-206ENSMUST00000190503 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm805-201ENSMUST00000181667 3160 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Phf6-201ENSMUST00000078944 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Ifit1bl2-202ENSMUST00000112463 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Hdac9-205ENSMUST00000209902 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Mir503-201ENSMUST00000102168 71 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm25396-201ENSMUST00000103981 133 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm12692-201ENSMUST00000121092 546 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 n-R5s47-201ENSMUST00000122516 119 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm13427-201ENSMUST00000154296 794 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Cd48-201ENSMUST00000015499 922 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Svs3a-201ENSMUST00000017147 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm23639-201ENSMUST00000175078 132 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Panct2-201ENSMUST00000181489 3849 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm27782-201ENSMUST00000185059 199 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 1810022K09Rik-202ENSMUST00000185384 435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm5835-201ENSMUST00000185806 1270 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm27680-202ENSMUST00000199221 807 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm44129-201ENSMUST00000203511 675 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Olfr471-201ENSMUST00000210091 936 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 AC164550.1-201ENSMUST00000217821 1066 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 AC116502.1-201ENSMUST00000220989 291 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Klrk1-201ENSMUST00000032252 1270 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Vmn1r78-201ENSMUST00000078039 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Zfp641-202ENSMUST00000169721 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Siae-202ENSMUST00000213126 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Actr6-201ENSMUST00000020109 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Cfb-206ENSMUST00000154526 2397 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Ehhadh-201ENSMUST00000023559 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Erp44-201ENSMUST00000030028 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Apobec4-201ENSMUST00000068875 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Prkg1-201ENSMUST00000065067 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Hsf2bp-201ENSMUST00000002145 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm16427-203ENSMUST00000201432 2042 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Pex5l-211ENSMUST00000194016 4206 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 BC049715-203ENSMUST00000203499 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm45805-201ENSMUST00000212695 2066 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Asxl2-201ENSMUST00000092003 11934 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm7978-201ENSMUST00000178552 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm26967-201ENSMUST00000182878 2303 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm37163-201ENSMUST00000195439 1690 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm44581-201ENSMUST00000206227 1693 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Slc12a1-203ENSMUST00000110495 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Odf2-202ENSMUST00000046571 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Prdx6b-201ENSMUST00000057072 2885 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm11926-201ENSMUST00000118520 430 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm15665-201ENSMUST00000119116 847 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm13252-201ENSMUST00000119355 321 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm15192-201ENSMUST00000121005 293 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm11882-201ENSMUST00000121463 506 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Sh3d2c-ps1-201ENSMUST00000121498 904 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Trim71Q1PSW8 Gm12525-201ENSMUST00000125412 554 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
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