Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Olfr737-ps1-201ENSMUST00000205382 283 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Bc1-ps1-201ENSMUST00000208471 318 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm45255-201ENSMUST00000209943 811 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 AC153541.1-201ENSMUST00000213786 294 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Olfr362-203ENSMUST00000215927 1210 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 1190001M18Rik-201ENSMUST00000215937 1270 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 RMST_1.1-213ENSMUST00000220288 792 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm45941-201ENSMUST00000221907 675 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm31063-201ENSMUST00000222636 580 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 AC140406.2-201ENSMUST00000227539 481 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 AC133654.1-201ENSMUST00000228411 672 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Smr3a-201ENSMUST00000031211 635 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Senp7-201ENSMUST00000049128 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Olfr432-201ENSMUST00000062665 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Olfr782-201ENSMUST00000077024 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Cd101-201ENSMUST00000147399 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Ap1b1-202ENSMUST00000101613 3735 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm44873-201ENSMUST00000208490 3428 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 D830044D21Rik-201ENSMUST00000143315 3897 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm8173-201ENSMUST00000186797 1977 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Olfr1189-202ENSMUST00000213679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Foxp3-202ENSMUST00000115738 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Txndc16-201ENSMUST00000022377 4028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Psg20-201ENSMUST00000076677 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm37731-201ENSMUST00000194545 2237 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gprasp2-211ENSMUST00000173804 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gcnt1-203ENSMUST00000174236 4606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Mef2c-218ENSMUST00000198199 2589 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm43615-201ENSMUST00000197465 1773 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm42737-201ENSMUST00000201074 1755 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Slc25a35-201ENSMUST00000018884 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Klrb1c-203ENSMUST00000174404 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm43041-201ENSMUST00000200022 2630 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Olfr1102-202ENSMUST00000214002 1806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Prkar2b-203ENSMUST00000146865 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm20712-201ENSMUST00000176387 1491 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Ccser2-207ENSMUST00000182797 1482 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Recql-203ENSMUST00000111803 3389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm37314-201ENSMUST00000193545 2685 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm26865-201ENSMUST00000180970 3284 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm44753-201ENSMUST00000207739 2335 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Ovol1-201ENSMUST00000025861 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 AC100590.1-201ENSMUST00000220318 1357 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Mgat4e-201ENSMUST00000052911 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 AC154461.2-201ENSMUST00000225462 1980 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Ctsl-205ENSMUST00000222517 6168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm18493-201ENSMUST00000192084 1612 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm42996-201ENSMUST00000196116 1636 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Mterf4-203ENSMUST00000112944 3097 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm26511-201ENSMUST00000181400 1895 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Zfp420-201ENSMUST00000057652 2744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm25083-201ENSMUST00000102319 92 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Cisd3-202ENSMUST00000107584 546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm13768-201ENSMUST00000116469 929 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm13666-201ENSMUST00000120032 799 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm13484-201ENSMUST00000120738 412 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm14979-201ENSMUST00000121561 1035 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 1700061J23Rik-201ENSMUST00000141678 537 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm10721-201ENSMUST00000143083 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm10715-201ENSMUST00000155807 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Rps6ka1-206ENSMUST00000168974 2982 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Vmn2r-ps77-201ENSMUST00000174505 320 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Vmn2r-ps12-201ENSMUST00000175833 623 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm20617-201ENSMUST00000177082 717 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm21847-201ENSMUST00000178227 1068 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm5973-201ENSMUST00000178542 496 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm17535-201ENSMUST00000178641 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm11168-204ENSMUST00000179881 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm27019-201ENSMUST00000183056 404 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm10637-201ENSMUST00000183718 828 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm29064-201ENSMUST00000187014 813 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 1700006F04Rik-201ENSMUST00000188582 441 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 C630050I24Rik-201ENSMUST00000193420 783 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 1700054O19Rik-201ENSMUST00000193604 868 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm44404-201ENSMUST00000203979 636 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm44665-201ENSMUST00000205381 251 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 AC117688.1-201ENSMUST00000213142 832 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 AC133948.1-201ENSMUST00000214867 599 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 AC161245.1-201ENSMUST00000217207 740 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Olfr790-204ENSMUST00000218901 1070 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Olfr1291-ps1-202ENSMUST00000219064 897 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 AC157017.1-201ENSMUST00000220148 364 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 AC163667.2-201ENSMUST00000223769 791 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 CT030194.2-201ENSMUST00000225752 379 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 AC140462.1-201ENSMUST00000225776 853 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 AC140208.1-201ENSMUST00000226609 285 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Olfr790-201ENSMUST00000056002 1070 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm4894-201ENSMUST00000067007 357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm10024-201ENSMUST00000075421 553 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Olfr312-201ENSMUST00000078217 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm22043-201ENSMUST00000082993 158 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm22830-201ENSMUST00000083772 130 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Gm10718-201ENSMUST00000099046 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 Skint7-201ENSMUST00000055014 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
LtbrP50284 CT009757.2-201ENSMUST00000220806 2028 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms