Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

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Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 AC131912.1-201ENSMUST00000217527 290 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Chd1P40201 AC161252.1-201ENSMUST00000225536 467 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Chd1P40201 AC156574.1-201ENSMUST00000227084 452 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Chd1P40201 AC154616.2-201ENSMUST00000227978 398 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Mlip-201ENSMUST00000034910 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Sprr2k-201ENSMUST00000067102 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Adgrg1-201ENSMUST00000093271 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Cdh13-201ENSMUST00000117160 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Atxn7l1-210ENSMUST00000144586 3042 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Prom1-202ENSMUST00000074113 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chd1P40201 AC126251.1-201ENSMUST00000228170 2707 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Kalrn-212ENSMUST00000114973 5253 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Cd22-202ENSMUST00000108125 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Ddx46-203ENSMUST00000223736 5612 ntAPPRIS P2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Rtp4-201ENSMUST00000038423 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Rab36-206ENSMUST00000146440 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Adgrf4-201ENSMUST00000024711 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Cyp1a1-202ENSMUST00000216433 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chd1P40201 AC107763.1-202ENSMUST00000225021 2663 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Slc2a5-201ENSMUST00000030826 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Scgb2b23-ps-201ENSMUST00000122094 330 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Gm12081-201ENSMUST00000152849 501 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Gm20620-201ENSMUST00000177528 168 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Chd1P40201 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Defb13-201ENSMUST00000060587 452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Chd1P40201 AC165148.1-201ENSMUST00000224795 2372 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Ptprr-201ENSMUST00000063470 3619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Gm32568-201ENSMUST00000212782 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Zfp239-201ENSMUST00000079405 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Cast-202ENSMUST00000220738 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Nr3c1-202ENSMUST00000097592 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Gm15127-202ENSMUST00000101190 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd1P40201 AC122426.2-201ENSMUST00000216522 2947 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Cd300a-202ENSMUST00000106582 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Gm25724-201ENSMUST00000104531 117 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Olfr634-ps1-201ENSMUST00000119267 955 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Gm9428-201ENSMUST00000127214 769 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Olfr92-201ENSMUST00000168659 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd1P40201 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Kif3c-204ENSMUST00000219895 2962 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd1P40201 E130119H09Rik-201ENSMUST00000223176 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd1P40201 AC154806.1-203ENSMUST00000227370 1032 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Vmn1r64-201ENSMUST00000078475 1011 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Rfpl4-201ENSMUST00000045215 1598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd1P40201 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Unc5c-201ENSMUST00000075282 3890 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Trim17-202ENSMUST00000075141 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd1P40201 D830032E09Rik-201ENSMUST00000186875 2193 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Olfr20-202ENSMUST00000120137 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Slc9b2-201ENSMUST00000051849 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Chd1P40201 4930480K23Rik-201ENSMUST00000180465 3326 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Lrmda-203ENSMUST00000159777 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Gm3140-201ENSMUST00000163523 481 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Svs3a-201ENSMUST00000017147 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Gm25690-201ENSMUST00000175439 77 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Olfr374-201ENSMUST00000209675 1053 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Gm6145-205ENSMUST00000211114 1148 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Gm5055-201ENSMUST00000215697 581 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Olfr481-201ENSMUST00000067143 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd1P40201 D830044D21Rik-201ENSMUST00000143315 3897 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Gm38277-201ENSMUST00000195172 1367 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Ttc21a-201ENSMUST00000035100 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd1P40201 G6pc2-202ENSMUST00000112317 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Trim43b-202ENSMUST00000189557 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Gm37960-201ENSMUST00000192402 1897 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Cpne8-202ENSMUST00000064391 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Olfr460-202ENSMUST00000216942 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Tmc2-201ENSMUST00000077988 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Luzp1-207ENSMUST00000170102 7526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Hal-202ENSMUST00000129421 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Ralgapb-202ENSMUST00000109485 6709 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Ppih-204ENSMUST00000106319 622 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Chd1P40201 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.4 ms