Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Olfr1175-ps-201ENSMUST00000214207 5552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
VimP20152 Srrm4os-201ENSMUST00000126959 3360 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
VimP20152 Olfr460-202ENSMUST00000216942 3370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
VimP20152 A530058O07Rik-201ENSMUST00000222059 3364 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
VimP20152 Ubxn7-201ENSMUST00000115151 10318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
VimP20152 Dnajb4-202ENSMUST00000050073 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
VimP20152 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
VimP20152 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
VimP20152 Npm1-203ENSMUST00000101375 966 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
VimP20152 Phyhd1-203ENSMUST00000113643 1195 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
VimP20152 Gm5228-201ENSMUST00000117186 357 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
VimP20152 Speer4d-202ENSMUST00000119100 857 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
VimP20152 Gm12917-201ENSMUST00000119850 639 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
VimP20152 Olfr1374-ps1-201ENSMUST00000120114 936 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
VimP20152 Gm13622-201ENSMUST00000120658 433 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
VimP20152 Gm22202-201ENSMUST00000158608 311 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
VimP20152 4930519F09Rik-202ENSMUST00000163084 1111 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
VimP20152 Paip1-206ENSMUST00000173627 1233 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
VimP20152 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
VimP20152 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
VimP20152 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
VimP20152 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
VimP20152 Gm45408-201ENSMUST00000211080 390 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
VimP20152 4930442G15Rik-201ENSMUST00000213112 1000 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
VimP20152 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
VimP20152 Gm18623-201ENSMUST00000219860 953 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
VimP20152 AC116487.1-201ENSMUST00000227033 339 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
VimP20152 Rps29-201ENSMUST00000037023 390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
VimP20152 Gm26132-201ENSMUST00000083166 148 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
VimP20152 Mir341-201ENSMUST00000093593 96 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
VimP20152 Snora57-201ENSMUST00000093658 148 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
VimP20152 Gm10354-201ENSMUST00000096953 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
VimP20152 Defa28-201ENSMUST00000098887 400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
VimP20152 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
VimP20152 CT030170.4-203ENSMUST00000221062 1403 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
VimP20152 Gm45634-201ENSMUST00000209736 1990 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
VimP20152 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
VimP20152 Dsg4-201ENSMUST00000019426 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
VimP20152 Ice2-201ENSMUST00000034761 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
VimP20152 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
VimP20152 Rs1-201ENSMUST00000033650 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
VimP20152 Gm10845-202ENSMUST00000228217 3389 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
VimP20152 Zfp239-207ENSMUST00000172088 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
VimP20152 Gm15930-201ENSMUST00000156603 2037 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
VimP20152 Hao2-201ENSMUST00000029464 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
VimP20152 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
VimP20152 Gm30329-201ENSMUST00000211572 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
VimP20152 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
VimP20152 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
VimP20152 Serpinb9-201ENSMUST00000006391 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
VimP20152 Cnot2-210ENSMUST00000168036 2693 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
VimP20152 Gm4221-202ENSMUST00000181765 2988 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
VimP20152 Paip1-202ENSMUST00000109203 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
VimP20152 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
VimP20152 Olfr396-ps1-201ENSMUST00000143750 1675 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
VimP20152 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
VimP20152 Nppb-201ENSMUST00000103231 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
VimP20152 Ighv1-55-201ENSMUST00000103526 415 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
VimP20152 Gm25803-201ENSMUST00000104419 131 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
VimP20152 Ucma-202ENSMUST00000115010 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
VimP20152 Gm11833-201ENSMUST00000118393 853 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
VimP20152 Gm15096-201ENSMUST00000121918 878 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
VimP20152 Tsc22d1-205ENSMUST00000133224 786 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
VimP20152 Tbata-208ENSMUST00000143207 982 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
VimP20152 Fbxl12-210ENSMUST00000155301 476 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
VimP20152 Vmn1r190-ps-201ENSMUST00000155950 903 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
VimP20152 Gm15093-201ENSMUST00000179021 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
VimP20152 Gm6669-201ENSMUST00000179088 997 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
VimP20152 Gm27224-201ENSMUST00000184749 564 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
VimP20152 Gm29291-201ENSMUST00000186055 686 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
VimP20152 1700036G14Rik-201ENSMUST00000189046 542 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
VimP20152 Gm2474-201ENSMUST00000195162 559 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
VimP20152 Gm3604-203ENSMUST00000202194 736 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
VimP20152 Gm44661-201ENSMUST00000208830 3503 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
VimP20152 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
VimP20152 Gm45274-201ENSMUST00000209938 647 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
VimP20152 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
VimP20152 Gm39383-201ENSMUST00000216894 1009 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
VimP20152 CT030175.1-201ENSMUST00000220822 408 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
VimP20152 CT010480.3-201ENSMUST00000224712 259 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
VimP20152 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
VimP20152 Ucma-201ENSMUST00000027978 756 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
VimP20152 Arhgef38-201ENSMUST00000054105 814 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
VimP20152 Tph2-201ENSMUST00000006949 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
VimP20152 Mir25-201ENSMUST00000083460 84 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
VimP20152 Gm826-201ENSMUST00000099127 637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
VimP20152 Asap1-208ENSMUST00000176014 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
VimP20152 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
VimP20152 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
VimP20152 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
VimP20152 Gm40778-201ENSMUST00000217825 1344 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
VimP20152 Zfp37-204ENSMUST00000220873 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
VimP20152 Usp17lc-201ENSMUST00000079348 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
VimP20152 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
VimP20152 Macrod2os1-201ENSMUST00000151538 3131 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
VimP20152 Gm6502-201ENSMUST00000086050 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
VimP20152 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
VimP20152 Olfr1441-202ENSMUST00000214153 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
VimP20152 C87977-202ENSMUST00000105754 1407 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
VimP20152 Gm43638-201ENSMUST00000201519 2297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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