Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Gm12123-201ENSMUST00000120348 472 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P20040 Gm13586-201ENSMUST00000121784 464 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P20040 A930104D05Rik-201ENSMUST00000128601 939 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
P20040 Crem-218ENSMUST00000139537 807 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P20040 Rpl29-203ENSMUST00000150576 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
P20040 Ttc9c-204ENSMUST00000153281 1192 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
P20040 Mir1962-201ENSMUST00000157516 121 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P20040 Gm23533-201ENSMUST00000157540 245 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P20040 Gm22847-201ENSMUST00000157707 105 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P20040 Gm6507-201ENSMUST00000159767 652 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P20040 Gm17660-201ENSMUST00000164471 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
P20040 Gm17234-201ENSMUST00000172128 392 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P20040 Tdgf1-ps1-201ENSMUST00000179882 516 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P20040 Gm29290-201ENSMUST00000185385 597 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P20040 Gm37799-201ENSMUST00000194018 547 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P20040 Gm37339-201ENSMUST00000194142 392 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P20040 Gm43471-201ENSMUST00000197550 467 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P20040 4930584F24Rik-204ENSMUST00000198070 1163 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
P20040 AC137678.1-201ENSMUST00000198370 118 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P20040 Gm43840-201ENSMUST00000199444 484 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P20040 Mrps33-204ENSMUST00000201461 717 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P20040 Gm5307-201ENSMUST00000204772 760 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P20040 Gm8489-201ENSMUST00000209876 1152 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P20040 AC163623.2-202ENSMUST00000214165 610 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
P20040 AC122305.2-201ENSMUST00000215148 834 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P20040 Gm4977-201ENSMUST00000215709 1262 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P20040 AC127254.1-201ENSMUST00000216563 524 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
P20040 Gm35035-201ENSMUST00000218838 628 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P20040 Uqcrb-201ENSMUST00000021993 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
P20040 Gm7239-201ENSMUST00000220981 860 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P20040 Gm40383-201ENSMUST00000222601 610 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P20040 CT030170.6-202ENSMUST00000223186 544 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P20040 AC131586.4-201ENSMUST00000228424 668 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P20040 4930433N12Rik-201ENSMUST00000048921 1204 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
P20040 6030452D12Rik-201ENSMUST00000066875 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
P20040 Arl9-201ENSMUST00000071199 402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P20040 Gm7493-201ENSMUST00000085919 626 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P20040 Sap30bp-203ENSMUST00000140991 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
P20040 Gm37080-201ENSMUST00000194804 2404 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
P20040 Olfr480-202ENSMUST00000217653 1876 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P20040 Bmpr1a-202ENSMUST00000165280 1945 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
P20040 Cntn4-206ENSMUST00000113264 5262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
P20040 Heph-201ENSMUST00000033553 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P20040 Apbb1ip-201ENSMUST00000014290 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P20040 Gm38155-201ENSMUST00000192285 2763 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P20040 Olfr76-203ENSMUST00000214676 3175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
P20040 Strada-203ENSMUST00000106867 3386 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P20040 Flrt3-202ENSMUST00000110057 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P20040 Gm39526-201ENSMUST00000208925 1413 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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P20040 Apbb2-210ENSMUST00000160870 6526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P20040 Rtel1-201ENSMUST00000048608 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P20040 Zbtb18-206ENSMUST00000193480 3734 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P20040 Glb1l2-201ENSMUST00000040398 3701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
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P20040 Olfr1440-202ENSMUST00000213657 7588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
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P20040 9530036M11Rik-201ENSMUST00000138767 1996 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P20040 Olfr1392-207ENSMUST00000217275 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
P20040 4930456G14Rik-201ENSMUST00000193054 1330 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
P20040 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P20040 Mme-201ENSMUST00000029400 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P20040 Serpina3c-201ENSMUST00000085050 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P20040 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
P20040 Brd8-201ENSMUST00000003876 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P20040 Gm37420-201ENSMUST00000195332 2912 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
P20040 Gm20597-201ENSMUST00000218774 5486 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
P20040 Gimap4-202ENSMUST00000090070 1804 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
P20040 Arfgef1-201ENSMUST00000088615 6978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
P20040 Olfr452-204ENSMUST00000217701 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
P20040 Cytip-201ENSMUST00000028175 6110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P20040 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P20040 Patj-203ENSMUST00000102792 3755 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P20040 Arhgef12-201ENSMUST00000072767 10059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
P20040 U2surp-209ENSMUST00000217176 3111 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
P20040 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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