Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gdap1-201ENSMUST00000026879 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm2065-201ENSMUST00000194697 2757 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Prom1-202ENSMUST00000074113 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Vmn1r51-201ENSMUST00000072859 2567 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm6819-201ENSMUST00000185325 1891 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Tpk1-203ENSMUST00000114644 2148 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Armcx3-201ENSMUST00000081834 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Zfp106-201ENSMUST00000055241 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Fasl-201ENSMUST00000000834 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm45182-201ENSMUST00000207579 2404 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Pramef6-201ENSMUST00000081645 1487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Tgfbr1-203ENSMUST00000107725 1713 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Naip1-202ENSMUST00000221727 1968 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm19272-202ENSMUST00000185181 2217 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Grik1-210ENSMUST00000228034 2708 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm44996-201ENSMUST00000208787 2980 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Iars-202ENSMUST00000164260 3789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Olfr1426-204ENSMUST00000219005 2507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Lrrtm4-205ENSMUST00000133918 2255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Cyp4a29-201ENSMUST00000118278 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Rnase4-201ENSMUST00000022428 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
Vpreb2P13373 Gm23131-201ENSMUST00000104253 132 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Pilrb1-201ENSMUST00000110978 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Rgs8-204ENSMUST00000111814 678 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm13879-201ENSMUST00000118308 242 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm12604-201ENSMUST00000118382 380 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm14131-201ENSMUST00000119636 719 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm4773-201ENSMUST00000120392 702 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 BC002163-201ENSMUST00000121906 319 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm12828-201ENSMUST00000136115 289 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm15418-201ENSMUST00000151014 677 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm22202-201ENSMUST00000158608 311 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm17711-201ENSMUST00000172028 237 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Lsm5-203ENSMUST00000176595 274 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Snhg7-201ENSMUST00000181621 139 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 1700003L19Rik-201ENSMUST00000190074 746 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm7115-201ENSMUST00000193706 832 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm37480-201ENSMUST00000194795 550 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm37432-201ENSMUST00000195294 341 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm8896-201ENSMUST00000197434 1106 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Dcp2-202ENSMUST00000202306 398 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm45901-201ENSMUST00000203807 661 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm26911-202ENSMUST00000204244 763 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm5307-201ENSMUST00000204772 760 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm44691-201ENSMUST00000207562 324 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm45024-201ENSMUST00000208274 623 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm44561-201ENSMUST00000208869 264 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm39662-201ENSMUST00000211909 1227 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm18378-201ENSMUST00000216245 628 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm18292-201ENSMUST00000216673 919 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 4930471E19Rik-202ENSMUST00000219150 737 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm5173-201ENSMUST00000219616 950 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm8153-201ENSMUST00000219844 952 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 AC211878.5-201ENSMUST00000221697 409 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm34611-201ENSMUST00000223252 627 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 AC147044.1-201ENSMUST00000223850 552 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 AC192333.4-201ENSMUST00000224269 981 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 AC131117.1-201ENSMUST00000225154 1171 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 AC154760.1-201ENSMUST00000227218 673 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 AC124709.1-201ENSMUST00000227296 620 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Olfr1449-201ENSMUST00000056005 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Prl7a2-201ENSMUST00000006660 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Olfr510-201ENSMUST00000076289 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 E230015B07Rik-202ENSMUST00000159884 2822 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Vmn2r-ps95-201ENSMUST00000222423 2316 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm20110-201ENSMUST00000218263 2095 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm38110-201ENSMUST00000194594 1551 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Serpinb6c-201ENSMUST00000110273 1325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Cntnap2-202ENSMUST00000114641 9827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm38200-201ENSMUST00000192083 2111 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 F930017D23Rik-202ENSMUST00000213342 2141 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Creb5-212ENSMUST00000205120 7482 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Paics-202ENSMUST00000117536 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 D830032E09Rik-201ENSMUST00000186875 2193 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Arid5b-203ENSMUST00000218532 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm37706-201ENSMUST00000195379 2765 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Olfr694-203ENSMUST00000216118 5035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Prep-201ENSMUST00000099858 10933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Dach2-203ENSMUST00000113379 2512 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 C920009B18Rik-202ENSMUST00000181223 4535 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Dnajc8-202ENSMUST00000094657 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 C030015A19Rik-201ENSMUST00000203368 2551 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 4933431K23Rik-204ENSMUST00000209273 2857 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm37530-201ENSMUST00000191759 4932 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Ift122-202ENSMUST00000112923 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Vmn1r188-203ENSMUST00000228243 8473 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Gm31614-201ENSMUST00000215504 3231 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Ulk4-209ENSMUST00000171923 4103 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Tpo-201ENSMUST00000021005 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Ganab-201ENSMUST00000096246 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Mtm1-205ENSMUST00000114617 3338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Mtm1-202ENSMUST00000033700 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Lrrc28-201ENSMUST00000032775 1817 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Vpreb2P13373 Clca3a2-201ENSMUST00000029929 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.7 ms