Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Gm25762-201ENSMUST00000103984 132 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Zfx-202ENSMUST00000113925 879 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm5228-201ENSMUST00000117186 357 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm15576-201ENSMUST00000117806 583 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm13680-201ENSMUST00000119790 793 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm12754-201ENSMUST00000121908 454 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Tsc22d1-205ENSMUST00000133224 786 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 A630023P12Rik-202ENSMUST00000141420 495 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Zfp572-202ENSMUST00000184208 1078 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Mir6403-201ENSMUST00000185007 129 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm29291-201ENSMUST00000186055 686 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm28193-201ENSMUST00000189863 615 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm5857-201ENSMUST00000198953 493 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm30771-201ENSMUST00000205683 737 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm9240-201ENSMUST00000206527 742 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Chmp2a-204ENSMUST00000211344 606 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Chmp2a-206ENSMUST00000211626 726 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm4800-201ENSMUST00000215776 1266 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 CT033774.2-201ENSMUST00000222079 256 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm32834-202ENSMUST00000222417 655 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Tctex1d1-208ENSMUST00000223169 683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
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Rnf4Q9QZS2 AC163667.2-201ENSMUST00000223769 791 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Olfr1445-201ENSMUST00000049624 1001 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 6030452D12Rik-201ENSMUST00000066875 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Olfr17-201ENSMUST00000098138 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Pikfyve-201ENSMUST00000081154 11237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm26705-201ENSMUST00000180761 1457 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Gm6866-201ENSMUST00000188559 2549 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Zmynd8-202ENSMUST00000088113 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Arhgap6-203ENSMUST00000112127 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 AC117232.2-201ENSMUST00000219469 2917 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Mapk10-201ENSMUST00000086854 6630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Zfp2-203ENSMUST00000116378 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Alb-201ENSMUST00000031314 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Vmn2r84-201ENSMUST00000094502 3034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rnf4Q9QZS2 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
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Rnf4Q9QZS2 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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Rnf4Q9QZS2 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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Rnf4Q9QZS2 Rpl22-201ENSMUST00000103191 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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Rnf4Q9QZS2 Kcnd3os-202ENSMUST00000143893 718 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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Rnf4Q9QZS2 Nup37-202ENSMUST00000169309 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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Rnf4Q9QZS2 Gm32921-201ENSMUST00000200592 810 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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Rnf4Q9QZS2 Slc16a4-202ENSMUST00000106723 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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Rnf4Q9QZS2 Olfr399-202ENSMUST00000215915 1796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 A930038B10Rik-201ENSMUST00000180412 4084 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Zfp110-205ENSMUST00000168247 2499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gin1-201ENSMUST00000027571 2494 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Nol8-205ENSMUST00000222197 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm5622-201ENSMUST00000096170 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 AC124414.1-201ENSMUST00000218033 2946 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 C630043F03Rik-201ENSMUST00000122923 2581 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Zscan21-204ENSMUST00000110960 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Kyat3-202ENSMUST00000106218 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Ace2-202ENSMUST00000112271 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Lgals9-202ENSMUST00000108268 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm44417-201ENSMUST00000203298 3359 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm43707-201ENSMUST00000196451 3187 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Mms19-217ENSMUST00000171561 6607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Cd247-209ENSMUST00000187313 2957 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm15950-201ENSMUST00000162902 1973 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Gm45634-201ENSMUST00000209736 1990 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf4Q9QZS2 Zfp143-205ENSMUST00000211798 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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