Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 AC163040.2-201ENSMUST00000223462 3534 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Ap2b1-205ENSMUST00000176430 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Zfp280d-217ENSMUST00000184517 3919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Recql5-201ENSMUST00000021097 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Igkv4-81-201ENSMUST00000103340 290 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm25877-201ENSMUST00000104326 129 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm20765-203ENSMUST00000181707 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm45303-201ENSMUST00000211239 676 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 AC127242.3-201ENSMUST00000222009 580 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Gm36758-201ENSMUST00000222594 310 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 AC165157.1-201ENSMUST00000222981 580 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 AC123665.3-201ENSMUST00000228735 1216 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 4930515G13Rik-201ENSMUST00000057521 492 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Olfr610-201ENSMUST00000063109 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Olfr1265-201ENSMUST00000080311 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Slx-201ENSMUST00000096913 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Rreb1-207ENSMUST00000128570 8436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Ap3m1-206ENSMUST00000154460 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Rims2-201ENSMUST00000042917 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Kcna2-201ENSMUST00000038695 11582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Olfr239-203ENSMUST00000214406 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Ttf2-201ENSMUST00000076941 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Trim2-205ENSMUST00000107693 5755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Mtfr1-202ENSMUST00000117529 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Lrba-206ENSMUST00000195524 3322 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Usp54Q8BL06 Cttnbp2-201ENSMUST00000090601 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Mme-201ENSMUST00000029400 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Plcd4-202ENSMUST00000067916 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 5430420F09Rik-201ENSMUST00000194956 1799 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 2600014E21Rik-201ENSMUST00000186411 4805 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm43168-201ENSMUST00000201039 1612 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Tll2-201ENSMUST00000025986 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Sycp2l-201ENSMUST00000124093 2641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm2178-201ENSMUST00000104927 357 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm8662-201ENSMUST00000118644 574 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Mir1900-201ENSMUST00000122714 78 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm7613-201ENSMUST00000139070 487 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm29156-201ENSMUST00000187764 499 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm42708-201ENSMUST00000196332 905 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm43846-201ENSMUST00000200502 932 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm4751-201ENSMUST00000200620 1105 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Scp2-ps2-202ENSMUST00000213851 609 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 AC155709.1-201ENSMUST00000218794 162 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 AC102312.1-203ENSMUST00000219530 763 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Olfr644-201ENSMUST00000077417 1071 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Stat1-206ENSMUST00000186857 4241 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm14565-201ENSMUST00000140021 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Sox6-212ENSMUST00000206369 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Myom1-203ENSMUST00000179759 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Rimbp2-205ENSMUST00000199537 6966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Trim40-201ENSMUST00000087158 2117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Olfr224-203ENSMUST00000216758 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 AC164433.1-201ENSMUST00000226138 1544 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Mtpn-201ENSMUST00000031866 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Akr1c20-202ENSMUST00000080361 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Stk36-201ENSMUST00000087183 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Erc1-203ENSMUST00000183703 8760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Adhfe1-203ENSMUST00000144177 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Tcaim-201ENSMUST00000052740 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 BC147527-202ENSMUST00000225029 1595 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Ttc9c-202ENSMUST00000096751 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Trub1-202ENSMUST00000026073 3795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Hivep3-209ENSMUST00000166542 7253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Arhgap17-211ENSMUST00000207010 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Mycbpap-202ENSMUST00000093945 3168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm28311-201ENSMUST00000185236 1497 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm28407-201ENSMUST00000185630 1497 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm28108-201ENSMUST00000186747 1497 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm28218-202ENSMUST00000186782 1498 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm29511-201ENSMUST00000187580 1497 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm28367-201ENSMUST00000187942 1496 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm29549-202ENSMUST00000189569 1497 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm28549-202ENSMUST00000191354 1497 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm37952-202ENSMUST00000192516 1497 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm42669-202ENSMUST00000160160 3080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm22774-201ENSMUST00000102084 109 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Igkv4-57-1-201ENSMUST00000103356 373 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Rpl15-ps1-201ENSMUST00000120694 564 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Obox3-ps3-201ENSMUST00000177242 1004 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm2888-202ENSMUST00000178577 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm8609-201ENSMUST00000182967 998 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm28266-201ENSMUST00000191410 439 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 2310046K23Rik-201ENSMUST00000193521 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm2860-201ENSMUST00000199226 707 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Gm45703-201ENSMUST00000212293 891 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Olfr473-201ENSMUST00000084761 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 RMST_1.1-209ENSMUST00000219444 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 AC126806.1-201ENSMUST00000217349 3869 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Tmem30c-201ENSMUST00000023434 2973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Usp54Q8BL06 Cdk14-204ENSMUST00000115452 1567 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
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