Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 Cdh23-203ENSMUST00000105462 10592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 A730085K08Rik-201ENSMUST00000177015 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Zfp938-201ENSMUST00000041264 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Elavl4-207ENSMUST00000106603 3761 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Gpr89-201ENSMUST00000029738 4598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Sycp1-201ENSMUST00000029448 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Ccdc150-201ENSMUST00000027128 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Nr1i3-208ENSMUST00000155126 2980 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Gm29077-201ENSMUST00000185784 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Gm28469-201ENSMUST00000186374 2166 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Gm28134-201ENSMUST00000188690 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Gm28696-201ENSMUST00000189187 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Gm28206-201ENSMUST00000190437 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Gm28593-201ENSMUST00000190989 2170 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Gm37075-201ENSMUST00000191888 2166 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Gm37574-201ENSMUST00000194264 2166 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Gm37657-201ENSMUST00000195425 2169 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Zscan4b-202ENSMUST00000210847 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Cyp2c29-201ENSMUST00000003137 1783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Gm20489-201ENSMUST00000117736 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Smg7-201ENSMUST00000043560 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Csnk1d-202ENSMUST00000070575 3500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Olfr1361-202ENSMUST00000214321 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Gm12321-201ENSMUST00000121485 804 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 1700025O08Rik-201ENSMUST00000123729 456 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Gm16224-201ENSMUST00000127711 412 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Cnih1-202ENSMUST00000146629 789 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Slc25a5-ps-201ENSMUST00000162199 826 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 1500004A13Rik-207ENSMUST00000184640 610 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Mir8105-201ENSMUST00000184718 89 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Gm28289-201ENSMUST00000189331 315 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Gm7412-201ENSMUST00000191692 605 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Gm43595-201ENSMUST00000196464 1071 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 5033403H07Rik-202ENSMUST00000198248 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Helt-202ENSMUST00000210652 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 AC153567.1-201ENSMUST00000218424 1263 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 1810014B01Rik-205ENSMUST00000218691 323 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 CT030238.4-202ENSMUST00000226143 745 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Atl3-201ENSMUST00000025668 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Olfr66-201ENSMUST00000079117 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Mllt3-202ENSMUST00000126353 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Gm5493-201ENSMUST00000182063 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Adgrg7-201ENSMUST00000023437 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Med23-201ENSMUST00000020159 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Kank4os-201ENSMUST00000133455 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Ppp1r3b-202ENSMUST00000210337 4349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Srrm1-201ENSMUST00000030613 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Zfp180-201ENSMUST00000068975 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Olfr523-202ENSMUST00000209314 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Meis1-209ENSMUST00000185131 3346 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Calb1-201ENSMUST00000029876 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Sc5d-201ENSMUST00000052725 4787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Kdsr-201ENSMUST00000010049 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Luzp1-203ENSMUST00000105849 7438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Osbpl6-203ENSMUST00000111930 3853 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Gm28649-201ENSMUST00000189153 1581 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 H3f3a-ps1-201ENSMUST00000119546 410 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Gm11850-201ENSMUST00000119679 479 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Gm6142-201ENSMUST00000120290 325 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Eif4e1b-203ENSMUST00000126785 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Gm14503-201ENSMUST00000130337 1164 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Gm16113-201ENSMUST00000159629 372 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Rnf170-ps-201ENSMUST00000181188 859 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 1700123O21Rik-201ENSMUST00000190515 677 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Gm44192-201ENSMUST00000204195 556 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 1810049I09Rik-201ENSMUST00000205499 453 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 4930584E12Rik-201ENSMUST00000216646 981 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Gm18631-201ENSMUST00000223125 1043 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Pes1-202ENSMUST00000109985 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Pes1-201ENSMUST00000020705 2911 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Fam107a-201ENSMUST00000036070 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Olfr1350-203ENSMUST00000219278 1768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Zfp641-202ENSMUST00000169721 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 F5-201ENSMUST00000086040 7430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Gm37410-201ENSMUST00000193623 3039 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Vmn2r55-201ENSMUST00000167771 1407 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Gimd1-203ENSMUST00000212594 1432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Gm42973-201ENSMUST00000197913 3200 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Atg4a-ps-201ENSMUST00000117271 2115 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Creb5-202ENSMUST00000203487 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 B930018H19Rik-201ENSMUST00000211381 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Apobec1-203ENSMUST00000112587 2072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Usp37-205ENSMUST00000189257 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Lama1-201ENSMUST00000035471 9518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Glrx-201ENSMUST00000022082 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Ptpn3-201ENSMUST00000075637 6369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 AC154171.3-201ENSMUST00000224519 2505 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Ep400-204ENSMUST00000112436 10685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Cast-207ENSMUST00000222588 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Gm36938-201ENSMUST00000191612 2696 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Plekhh1-204ENSMUST00000219956 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Klhl10-202ENSMUST00000107395 932 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Prelid3b-202ENSMUST00000117442 683 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Gm13798-201ENSMUST00000118285 139 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Gm12713-201ENSMUST00000118404 764 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Hmgb4os-201ENSMUST00000131581 518 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 0610043K17Rik-202ENSMUST00000142581 372 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Shq1Q7TMX5 Svs6-201ENSMUST00000017144 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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