Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm8276-201ENSMUST00000192231 1812 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 AL606496.1-201ENSMUST00000220673 4472 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Eci3-201ENSMUST00000021853 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 4930524O08Rik-201ENSMUST00000183387 1451 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1155-203ENSMUST00000215903 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Olfr472-203ENSMUST00000216937 5392 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 5830432E09Rik-201ENSMUST00000180693 3569 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm35206-201ENSMUST00000217945 1642 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gdap10-201ENSMUST00000180613 5003 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm14762-201ENSMUST00000105109 1771 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm42973-201ENSMUST00000197913 3200 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Ighv5-9-1-201ENSMUST00000103452 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm14202-201ENSMUST00000120121 311 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm11676-201ENSMUST00000120443 490 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm13495-201ENSMUST00000121156 537 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm11895-201ENSMUST00000122165 467 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Pfn2-204ENSMUST00000122210 810 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm14617-201ENSMUST00000128053 798 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Crem-209ENSMUST00000129435 1160 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm12708-202ENSMUST00000136941 1046 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Mir1964-201ENSMUST00000158514 83 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Ifrd1-204ENSMUST00000165027 1293 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm4302-201ENSMUST00000168769 927 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm23563-201ENSMUST00000174900 251 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm9423-201ENSMUST00000183173 997 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm24362-201ENSMUST00000183220 416 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm27199-201ENSMUST00000185026 623 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 I830127L07Rik-201ENSMUST00000187250 730 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm28530-201ENSMUST00000190473 577 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm29050-202ENSMUST00000190865 502 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm29250-201ENSMUST00000191372 368 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm37012-201ENSMUST00000194991 1078 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm37561-201ENSMUST00000195221 368 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 1700041I07Rik-201ENSMUST00000197536 435 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm30301-201ENSMUST00000199474 652 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm43122-202ENSMUST00000202259 526 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm44245-201ENSMUST00000204304 232 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm30781-201ENSMUST00000204743 216 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Mypopos-204ENSMUST00000206381 473 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm10451-202ENSMUST00000219367 855 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Serpinb6d-202ENSMUST00000221681 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 AC140477.3-201ENSMUST00000222271 475 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 AC159293.1-201ENSMUST00000222662 545 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 AC153153.1-201ENSMUST00000225803 793 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Tex29-201ENSMUST00000033909 822 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1445-201ENSMUST00000049624 1001 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm6578-201ENSMUST00000080891 984 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Tbxas1-206ENSMUST00000162521 1427 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Pvt1-202ENSMUST00000181416 3319 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Schip1-207ENSMUST00000182997 1557 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm26545-201ENSMUST00000181082 1746 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Coro2a-203ENSMUST00000107757 4124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r88-201ENSMUST00000022438 2574 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm21781-201ENSMUST00000178920 4838 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm10855-201ENSMUST00000100426 2541 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Epgn-201ENSMUST00000041516 1760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Cdc42bpa-202ENSMUST00000097450 5160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Fancd2-208ENSMUST00000204827 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Pramef6-201ENSMUST00000081645 1487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 1700011H14Rik-201ENSMUST00000022398 1349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Sell-203ENSMUST00000192047 5703 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Adam21-201ENSMUST00000008582 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Olfr212-203ENSMUST00000220134 2349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Olfr43-202ENSMUST00000205664 2018 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Mum1l1-201ENSMUST00000113041 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1278-203ENSMUST00000213727 6744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps54-205ENSMUST00000182110 2587 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Atp13a5-201ENSMUST00000075806 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc141-203ENSMUST00000111833 631 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Olfr634-ps1-201ENSMUST00000119267 955 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm9097-201ENSMUST00000120514 880 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 4930555O08Rik-201ENSMUST00000122821 668 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm13580-201ENSMUST00000131457 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm12064-201ENSMUST00000133819 533 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Klra8-201ENSMUST00000014476 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Tmbim6-203ENSMUST00000159531 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 B230118H07Rik-209ENSMUST00000160722 931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Spc25-209ENSMUST00000167875 1194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r1-201ENSMUST00000169123 921 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm20447-201ENSMUST00000173290 599 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm26974-202ENSMUST00000183263 930 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 2310005E17Rik-201ENSMUST00000186644 1187 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm37822-201ENSMUST00000192618 1109 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 4930432M17Rik-202ENSMUST00000196899 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Igkv12-42-201ENSMUST00000198769 327 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm9523-201ENSMUST00000199146 1159 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms