Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Ccdc80-202ENSMUST00000099498 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm28720-201ENSMUST00000190728 3156 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Galnt5-201ENSMUST00000112616 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Ppp2r5c-202ENSMUST00000109832 4108 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm19031-201ENSMUST00000176280 1365 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 AC124675.1-201ENSMUST00000226263 1390 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm45182-201ENSMUST00000207579 2404 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm45534-201ENSMUST00000211449 2339 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Adam3-201ENSMUST00000033958 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Eif4a2-202ENSMUST00000077605 2708 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Igkv2-137-201ENSMUST00000103302 501 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm13521-201ENSMUST00000118922 866 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm13463-201ENSMUST00000119020 233 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm12632-201ENSMUST00000121223 495 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Cd180-202ENSMUST00000167144 430 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Fundc1-205ENSMUST00000177213 1032 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Trav12d-3-201ENSMUST00000177703 347 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm29144-201ENSMUST00000189235 339 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm29238-201ENSMUST00000189709 695 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm28607-201ENSMUST00000190142 339 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm28121-201ENSMUST00000191420 339 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm37612-201ENSMUST00000193626 582 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm37469-201ENSMUST00000193728 890 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm37724-201ENSMUST00000195240 1221 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 AC138604.2-201ENSMUST00000226620 921 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Ly6g-201ENSMUST00000023246 336 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Ppbp-201ENSMUST00000031319 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Spink6-201ENSMUST00000068473 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Flrt3-202ENSMUST00000110057 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 AC122426.1-201ENSMUST00000214736 2235 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Pitpnc1-201ENSMUST00000040380 5478 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Smad5-201ENSMUST00000069557 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Mgam-202ENSMUST00000201148 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Mgam-201ENSMUST00000071535 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Stab2-201ENSMUST00000035288 8228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm11855-201ENSMUST00000121562 1869 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Ncald-203ENSMUST00000119730 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Ccdc127-201ENSMUST00000022063 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm13762-202ENSMUST00000168169 2180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gucy1a3-201ENSMUST00000048976 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 4921528I07Rik-202ENSMUST00000213446 3798 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Asb14-201ENSMUST00000090337 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Adgrg7-201ENSMUST00000023437 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm31267-201ENSMUST00000218941 1397 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 AC166159.1-201ENSMUST00000227154 1380 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Ms4a13-201ENSMUST00000073380 1375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Sspo-206ENSMUST00000212740 15408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Efl1-206ENSMUST00000207868 1537 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 E430024I08Rik-202ENSMUST00000220632 1513 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Parp11-201ENSMUST00000039680 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm28497-201ENSMUST00000189646 3029 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Grip1-211ENSMUST00000144959 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Senp6-203ENSMUST00000165607 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Igkv8-27-201ENSMUST00000103381 300 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm25546-201ENSMUST00000103977 132 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 1700092K14Rik-201ENSMUST00000106604 395 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm15054-201ENSMUST00000117393 281 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Zfp473-202ENSMUST00000118162 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm14480-201ENSMUST00000118521 433 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Dnajc5b-202ENSMUST00000118735 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 2500004C02Rik-202ENSMUST00000128026 1898 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 AW495222-202ENSMUST00000149839 868 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm24782-201ENSMUST00000157641 132 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Znrf1-210ENSMUST00000173781 337 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 4833412C05Rik-201ENSMUST00000181235 1083 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 6720483E21Rik-201ENSMUST00000181654 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 4930448K20Rik-202ENSMUST00000182072 1433 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm27458-201ENSMUST00000185108 121 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm5147-201ENSMUST00000185999 794 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm8883-202ENSMUST00000188258 545 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Olfr318-201ENSMUST00000189911 1026 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm7512-201ENSMUST00000195217 1170 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm42656-201ENSMUST00000201506 2305 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm43812-202ENSMUST00000202701 581 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm44245-201ENSMUST00000204304 232 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Olfr320-201ENSMUST00000204718 928 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 4930425L21Rik-202ENSMUST00000205073 871 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Aadat-202ENSMUST00000209338 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm45350-201ENSMUST00000210560 509 ntTSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Cdc42-201ENSMUST00000030417 1448 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Olfr125-201ENSMUST00000050255 1118 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Olfr1494-201ENSMUST00000051768 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Cs-201ENSMUST00000005826 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gm5426-201ENSMUST00000074615 312 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Olfr961-201ENSMUST00000076548 949 ntAPPRIS P1 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Grxcr1-201ENSMUST00000094715 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Dock2-201ENSMUST00000093193 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Gbp11-201ENSMUST00000100960 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Atp2b4-201ENSMUST00000048953 8292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Slc12a1-202ENSMUST00000110494 4740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Oas1e-203ENSMUST00000201172 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Htt-201ENSMUST00000080036 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 R3hdm2-202ENSMUST00000077046 4029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Vmn2r12-201ENSMUST00000095922 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 2210408I21Rik-202ENSMUST00000225605 1539 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Prkd3-202ENSMUST00000118768 2847 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Mtm1-205ENSMUST00000114617 3338 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Mtm1-202ENSMUST00000033700 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 Slc8a1-202ENSMUST00000163123 2877 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Trim71Q1PSW8 4933431K23Rik-204ENSMUST00000209273 2857 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
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